机器学习(逻辑回归实现癌症预测)
1. 数据集介绍
数据描述
(1)699 条样本,共 11 列数据,第一列用语检索的 id,后 9 列分别是与肿瘤
相关的医学特征,最后一列表示肿瘤类型的数值。
(2)包含 16 个缺失值,用”?”标出。
【机器学习(逻辑回归实现癌症预测)】该案例的数据我会上传到CSDN,请自行搜索下载2. 案例分析
- 缺失值处理
# 将?转化为np.nan
data.replace("?",np.nan,inplace=True)
# 删除缺失值
data.dropna(how='any',axis=0,inplace=True)
- 标准化处理
# 将数据标准化处理
st =StandardScaler()
st.fit_transform(x_train)
st.fit_transform(x_test)
- 逻辑回归预测
# 进行逻辑回归预测
lg=LogisticRegression()# 训练数据
lg.fit(x_train,y_train)# 预测数据
y_predict=lg.predict(x_test)print("y_predict",y_predict)
- 预测的准确率
print("预测的准确率:",lg.score(x_test,y_test)) # 准确率为95以上,准确率很好
- 进行分类评估
report = classification_report(y_test,y_predict,labels=[2,4],target_names=['良性','恶性'])
- 样本均衡情况下,不需要看auc,只是在样本不均衡的情况,auc很适合
计算AUC指标, 进行 目标值处理 ,本来是 2 ,现在需要0 和 1
ytest = np.where(y_test > 2.5, 1, 0)
res = roc_auc_score(y_test,y_predict) # auc指标为0.97
3. 全部代码
importpandas as pd
importnumpy as npfromsklearn.model_selection import train_test_splitfromsklearn.preprocessing importStandardScaler# 逻辑回归
fromsklearn.linear_model importLogisticRegression# 模型评估
fromsklearn.metrics importclassification_report# AUC 指标计算
fromsklearn.metrics import roc_auc_score# 加载数据
data = https://www.it610.com/article/pd.read_csv("./breast-cancer-wisconsin.data")
# print(data)
#
# print("data 的类型:",type(data))#设置列名称
columns = ['Sample code number','Clump Thickness','Uniformity of Cell Size','Uniformity of Cell Shape','Marginal Adhesion','Single Epithelial Cell Size','Bare Nuclei','Bland Chromatin','Normal Nucleoli','Mitoses','Class']# 先将数据转化为df
# df_data = https://www.it610.com/article/pd.DataFrame(data.values,columns=columns)
#
# print(df_data)# 更改列名称
data.columns = columnsprint(data.shape)# 将?转化为np.nan
data.replace("?",np.nan,inplace=True)# 可以使用dropnan进行删除缺失值
data.dropna(how='any',axis= 0 ,inplace=True)print("去除缺失值之后的形状:",data.shape)# 选取特征值,目标值
x = data.iloc[:,1:10].values
y = data.iloc[:,-1].values
# 进行数据集拆分
# 返回特征值
# 返回目标值
x_train,x_test,y_train,y_test = train_test_split(x,y,test_size=0.3)#数据的标准化处理
st = StandardScaler()# 进行标准化数据
st.fit_transform(x_train)
st.fit_transform(x_test)# 进行逻辑回归预测
lg = LogisticRegression()# 训练数据
lg.fit(x_train,y_train)# 预测数据
y_predict = lg.predict(x_test)print("y_predict:",y_predict)print("权重:",lg.coef_)print("偏置:",lg.intercept_)# 预测的准确率--比对y_predict ,y_test
print("预测的准确率:",lg.score(x_test,y_test)) # 准确率为95以上,准确率很好# 进行分类评估
report = classification_report(y_test,y_predict,labels=[2,4],target_names=['良性','恶性'])print(report)# 样本均衡情况下,不需要看auc,只是在样本不均衡的情况,auc很适合
# 计算AUC指标
# 进行 目标值处理
# 本来是 2 和4
# 现在需要0 和 1# y_test = np.where(y_test > 2.5, 1, 0)
#
# # print(y_test)
#
# res = roc_auc_score(y_test,y_predict) # auc指标为0.97
#
# #
# print(res)
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