扩增子分析
微生太扩增子分析系列第八节：QIIME2+Galaxy PICRUSt进行16S功能预测
扩增子测序是一种二代靶向测序技术，它使用PCR技术来生成称为扩增子的DNA序列，它简单、快速、应用广泛。扩增子测序可以有效地识别微生物高可变区并有效获取微生物物种的信息。
扩增子测序主要包括16S rDNA测序、18S rDNA测序、ITS测序及目标区域扩增子测序等。16S rDNA是细菌分类学研究中最常用分类的marker基因信息，其序列包含9个可变区（Variable region）和10个保守区（constant region）。可变区因细菌而异，且变异程度与细菌的系统发育密切相关。通过检测16S rDNA的序列变异和丰度，可以了解环境样品中群落多样性信息。基于16S rDNA的分析在微生物分类鉴定、微生态研究等方面起到重要作用，目前是研究海洋、土壤、肠道粪便等环境中的微生物群落构一种重要普遍的研究方法。
针对扩增子测序的统计分析流程，我们制作了8节免费系列分析课程来对扩增子分析进行介绍。
1.α多样性分析及绘图(添加显著性标记的箱线图)，
2.β多样分析及绘图（PCoA，NMDS），
3.相关性分析及绘图（添加显著性标记的热图），
【扩增子分析】4.论文图片的编辑和排版，
5.微生太16S分析结果文件夹及结题报告的解读，
6.使用LEFSE寻找在组间有差异的特征微生物，
7.
R语言Venn图分析组间特有和共有的物种，
8.
QIIME2+Galaxy PICRUSt进行16S功能预测。
文章图片
为了回馈关注微科享的粉丝们，本次分享免费第八场，QIIME2+Galaxy PICRUSt进行16S功能预测。
[if !supportLineBreakNewLine]
[endif]
关注《微科享》公众号，添加以下VX(M18126463003)，备注《QIIME2+Galaxy
PICRUSt进行16S功能预测》领取，即可获得课程的链接。
推荐阅读
- 2018年11月19日|2018年11月19日 星期一 亲子日记第144篇
- 遇到一哭二闹三打滚的孩子，怎么办┃山伯教育
- 这辈子我们都不要再联系了
- 2019年12月24日
- Ⅴ爱阅读，亲子互动——打卡第178天
- 眼观耳听美食的日子
- 子龙老师语录
- 如何寻找情感问答App的分析切入点
- 成交的种子咖啡冥想
- 2018年9月5日，星期三，天气晴