可持久化数据结构
零、介绍
最近在刷MIT 6.851,记录下笔记。
What
可持久化数据结构就是能存储、查询数据的历史版本的数据结构。
参考资料
- Videos
MIT 6.851 Advanced Data Structures
后面就听不懂了,就前面讲概念(persistent分为4类blabla)能听懂。没有很好的结合图讲,讲得不好。反正听不懂的就是讲得不好:)
- Text
可持久化数据结构简介
MIT 6.854j-advanced-algorithms
很赞!!可惜没video。
Making Data Structures Persistent
太长没看
一、应用(能解决什么问题) 总结了下大致包括如下领域应用:
并发领域
并发事务的原子性(便于Rollback)、隔离性。
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image.png https://io-meter.com/2016/09/03/Functional-Go-persist-datastructure-intro/
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函数式编程
同上。
版本控制功能
便于实现diff,rollback
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js有个专门的库 最新immutable.js持久化数据结构
看起来是配合前端框架React(React + Flux + ImmutableJS )写函数式编程用的。
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计算几何
字符串处理
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image.png 参考资料
可持久化数据结构简介
自己轮一个.net可持久化库Persistent Data Structures下面有讨论use case
中文翻译见可持久化数据结构
Functional Go: 持久化数据结构简介
二、分类
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这部分可以看6.851视频
三、通用的实现方法:如何将链式数据结构改造成(partial/full)可持久化 6.851把链式数据结构的模型叫pointer machine model。对于基于pointer machine model的数据结构,有没有通用的方法将他们改造成persistent?
3.1. 先考虑怎么改造成partial persistence
a. fat nodes
add a modification history to every node. Thus, each node knows what its value was at any previous point in time. (For a fully persistent structure, each node would hold a version tree, not just a version history.)O(1)写,读时对于每个点都要执行O(logm)的查询
看到这里有个问题:每个点的history放hashmap里不就行了?读时也只需要O(1)的查找
但这样做的话,hashmap不支持ceil操作,因此要支持ceil没办法只能用有序结构、log级别查询
个人理解,想做可持久化key/value Map的话即可按这种方法,每个key对应的entry存放所有历史值,这也可以看成是邻接表。
b. path copying
说白了就是写时分裂节点,从root开始分裂到要写的点。将所有version的root存到字典里
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修改时放box,满了就分裂出来一个新节点,分裂时自动apply log
算法竞赛中的可持久化线段树就属于用这种方法实现的partial persistent线段树,读时需要花O(1)或者O(logm)查找root,之后的查询无需额外时间;写时要分裂O(d),d代表树高,平衡树O(logN),非平衡比如链表就是O(N)
c. modification box
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难以置信,说白了就是给path copying方法中每个node加一个log cache,最后算出来的写时amortized time complexity就是O(1)了。
What about non-tree data structures?
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image.png 平衡树怎么处理?
平衡树要旋转,想想就感觉很难改造成持久化。6.854课件讲的很粗没懂。算法竞赛中常用的可持久化平衡树一般就是 可持久化无旋转 Treap,省去了旋转可持久化的复杂。
3.2. 如何改造成full persistence
a. fat nodes
每个点存的log从version queue变成version tree,查询每个点时要从树中找到最近祖先
b. path copying
没区别
c. modification box
怎么找根节点?
i. pointer per version,可能多个pointer指向一个root
ii.存root tree,查询时先找最近祖先
怎么修改old version
i. 修改时放box,满了就分裂出来一个新节点
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image.png 但这样有问题:分裂出来的还是满的,如果整条链都是满的,每次修改复制全部,下次修改还得复制全部。而且这样还不好存root,比如最右边图,代表0的root有俩
ii. 修改时放box,满了就分裂出来一个新节点,但分裂时自动apply有用的log、丢弃没用的log
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image.png What about non-tree data structures?
6.851有讲,分裂成两个节点,log分成两部分,新节点拿一个子树的log,新节点apply log直到自己的子树,每部分丢弃自己用不到的。
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image.png 四、通用的实现方法:将链式数据结构改造成confluent/functional persistence 6.851讲了 太复杂没听懂。
五、具体实现 网上关于可持久化数据结构的优质资料都是算法竞赛的,因此收集总结了下竞赛常用的。看了下基本都是partial persistent,有的是fully persistent,都没用到modification box技术。
可持久化线段树
https://www.bilibili.com/video/BV1C4411u7rK?p=1
可持久化字典树
https://www.geeksforgeeks.org/persistent-trie-set-1-introduction/
和可持久化线段树类似的方法,基于path copy实现partial persistence。
问题是每个点在拷贝时都要复制O(R)个指针,插入的时间复杂度为O(len*R)
查询时先从字典(数组/哈希表)里找到指定version的root,然后访问,O(len)
在竞赛中常用的是可持久化01字典树,比如xor问题,见https://oi-wiki.org/ds/persistent-trie/,没看懂
可持久化平衡树
算法竞赛中常用的可持久化平衡树一般就是 可持久化无旋转 Treap,省去了旋转可持久化的复杂。
fully persistent array
【AgOHの数据结构】可持久化数组
https://www.luogu.com.cn/problem/P3919
方案:
a. fat nodes
每个节点放所有历史,查询时在所有历史版本中找最近祖先版本
b. path copying
存到可持久化线段树里。
为什么好好的线性结构要树化?直觉上理解,是为了分裂新版本时减少指针复制。
如果是稀疏数组,朴素方法太浪费空间了,可以基于动态开点来优化空间存储,见https://io-meter.com/2016/11/06/functional-go-intro-to-hamt/
可持久化并查集
【AgOHの数据结构】可持久化并查集
并查集基于数组,可持久化并查集就基于可持久化数组。可持久化数组用可持久化线段树实现,因此可持久化并查集用可持久化线段树实现
可持久化块状链表
《 可持久化数据结构研究 》
不过文中写的太简略了,个人推测的维护方法为:
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每次写操作的时间复杂度O(根号N)
ADT:Persistent List/Stack
https://io-meter.com/2016/09/03/Functional-Go-persist-datastructure-intro/
讨论支持如下操作的抽象数据结构(ADT)如何可持久化:
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image.png a. 基于普通数组
只能copy on write
b. 基于可持久化数组/可持久化线段树
问题是怎么处理新增节点、删除节点?得想办法魔改线段树
c. 可持久化链表
d. 可持久化块状链表
e. 可持久化平衡树
f. 文中提到的vector trie
名字挺骚的没反应过来,看了一会发现:这玩意就是可持久化数组(可持久化线段树),只不过是多叉树,叫“可持久化多叉线段树”比较形象。文章也没提怎么处理新增节点、删除节点。
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image.png ADT:Persistent key-value map
persistent-hash-table-implementation
a. 可持久化平衡树
b. 还用hashmap,但是每个entry改造成fat node(存放所有log),查询时先找到entry,再在所有log 中找最近祖先版本
c. 可持久化数组。
考虑到HashMap本来就能只用一个数组实现(解决冲突时用open addressing方法,不用Chaining),那么实现了可持久化数组就相当于实现了可持久化HashMap
d. Hash_trie
hash(key)的值存在trie里,value放到trie的叶子节点。优化版本包括Hash array mapped tries and Ctries
HAMT这名字起的很奇怪。原理就是块状hash trie(所谓块状是我自己起的名,指每个节点区分儿子时不是单纯的比较某1位,而是比较某2位甚至多位)(或者理解成hash trie+动态开点多叉线段树也行)(反正就是bitwise hash trie加上一堆优化,懒得记就记hash trie就行了,真要自己实现的时候这些优化trick也能想到)
文中讲hamt的碰撞处理有点扯,个人理解可以chaining,可以open addressing。细节没深究,可以看论文和讨论。按作者的意思AMT是之前他提出的一种Trie的优化,比Tenary search trie要好。
Array Mapped Tries(AMT), first described in Fast andgit的数据结构?
Space Efficient Trie Searches, Bagwell [2000],
// TOOD
六、思考 最优的二维range minimum query数据结构是什么?
朴素的方法是线段树套线段树,以便支持二维RMQ,时间复杂度O(logN*logN)。
个人理解,最优的二维RMQ数据结构应该是用modification box实现的可持久化值域线段树,O(N)的构造时间、空间,O(logN)的查询。
二维统计问题的通用数据结构
如果统计操作具有“区间可加性”、“区间可减性”,那么该操作二维统计问题可以使用可持久化线段树。
range minimum query中的min()操作其实不具有区间可减性,但是range minimum query问题可以归约成range select query问题,进而可以归约成range count query问题,而count()操作具有区间可加减性,因此也能用可持久化线段树。
所以我们得到了一类二维统计问题的通用数据结构:对于可归约成具有“区间可加性”、“区间可减性”统计操作的二维统计问题,可以使用可持久化线段树存储,以便支持快速查询(统计)。
[ ] 高维统计问题的归约?
能否找到一类高维统计问题,具有通用的logN级别解?个人理解可以借鉴代数的思想,只要有区间可加减性的都能归约成K维RMQ问题,用modification box实现的可持久化值域线段树解决。
// TOOD 只是个人畅想,没细想。
外存模型下的可持久化数据结构
可持久化Map bigtable(hbase)可以看成外存模型下的可持久化map:
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image.png 但需要注意的是删除操作会真的删掉之前的老版本数据:
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image.png 【可持久化数据结构】其实任何支持前缀匹配的db都能作为可持久化map,你只需要把rowkey设计成"key@@timestamp"即可
http://hbase.apache.org/book.html#reverse.timestamp
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