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生物信息学用go语言 生物信息学用go语言吗( 四 )

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总结：
Gene Ontology（GO）包含了基因参与的生物过程 ， 所处的细胞位置 ， 发挥的分子功能三方面功能信息，并将概念粗细不同的功能概念组织成DAG（有向无环图）的结构 。
Gene Ontology是一个使用有控制的词汇表和严格定义的概念关系 ， 以有向无环图的形式统一表示各物种的基因功能分类体系，从而较全面地概括了基因的功能信息 ， 纠正了传统功能分类体系中常见的维度混淆问题 。
在基因表达谱分析中，GO常用于提供基因功能分类标签和基因功能研究的背景知识 。利用GO的知识体系和结构特点，旨在发掘与基因差异表达现象关联的单个特征基因功能类或多个特征功能类的组合 。
原文：
GO(Gene Ontology)Ontology 首先是出现于哲学领域的一个词汇，后来广泛用于计算机领域，发挥了很重要的作用，再后来这个概念被引入生物领域 。
gene Ontology 是生物中Ontology中一个重要应用 。go项目最初是由研究三种模式生物（果蝇、小鼠和酵母）基因组的研究者共同发起 。是生物信息分析中很重要的一个方法
go是在生物领域应用非常广，可以帮助生物学家对基因产物进行准确的定义（功能、位置），节省时间 。
因为在最开始的时候，生物学家们更多是专注于自己研究的物种/课题，而且每个生物学家对功能等的定义是存在差异的，导致不同实验室/物种不能实现直接的对接（比如A物种内的x基因的功能使用的是a这个词汇进行注释，而B物种内的x基因的功能却使用的是与a同义的词汇b进行注释，这种情况计算机无法识别），就像讲两种语言的人，无法直接进行语言交流 。这种情况导致的问题是，出现了一种阻碍，让问题复杂化了 。所以就有了Ontology在生物领域中的应用，实现“书同文” 。
go定义了基因/基因产物的功能（通过术语）且定义了它们各自之间功能是怎样联系的（关系） 。它组成了一个具有大量term的词汇库 ， 并定义各种term之间的关系（is_a part_of R） 。
GO通过三个方面的术语对基因/基因产物的功能进行描述：分子功能(molecular function) -由基因/基因产物行使的分子水平上的功能； 细胞组件(cellular component)-基因/基因产物产生功能时其在细胞结构上的位置；生物学过程(biological process)-在哪个生物学通路/生物过程发挥作用 。
目前，GO 注释主要有两种方法：
（1）序列相似性比对（BLAST）：例如blast2go（将blast结果转化为GO注释）
（2）结构域相似性比对（InterProScan）
blast2go的本地化教程：
在blast2go软件正确安装的情况下，使用blast2go进行go注释，出现无法得到注释结果的问题：
另外还有可能出错的原因是，blast2go无法识别blast高的版本号，当使用高版本的blast的时候，直接将版本号给修改为低版本的就行了，例如（BLASTX 2.2.25+）
GO 的图形是一个有向无环图
生物信息学中GO是什么意思GO是Gene Ontology生物信息学用go语言的简称生物信息学用go语言，是生物学家为生物信息学用go语言了衡量基因的功能而而发起的一个项目生物信息学用go语言，从分子功能（molecular function）、生物学过程（biological process）和细胞定位（cellular component）三个面对基因功能进行全面定义；下面有个详细介绍生物信息学用go语言，你可以参考下 。
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