文章目录
- 1 快速理解
-
- 1.1 算法步骤
- 1.2 一个例子
- 2 K-means步骤详解
-
- 2.1 K值的选择
- 2.2 距离度量
- 2.3 新质心的计算
- 2.4 停止条件
- 3 K-means算法实现
-
- 3.1 创建数据集
- 3.2 kmeans函数实现
-
- 3.2.1 random.sample(sequence, k)
- 3.2.2 np.all()
- 3.2.3 np.any()
- 3.3 Updata_cen 函数实现
-
- 3.3.1 np.argmin(data, axis=None, out=None)
- 3.3.2 df.groupby().mean()
- 3.4 Distance 函数实现
-
- 3.4.1 np.tile(data, (x, y))
- 3.4.2 计算欧式距离
- 3.4.3 np.sum(数组,axis=None)
- 4 代码
1 快速理解
- K 均值聚类算法 K-means Clustering Algorithm
- k-means算法又名
k均值算法
。K-means算法中的k表示的是聚类为k个簇,means代表取每一 个聚类中数据值的均值作为该簇的中心,或者称为质心,即用每-一个的类的质心对该簇进行描述。
- 其算法思想大致为:先从样本集中随机选取k个样本作为簇中心,并计算所有样本与这k个“簇中心”的距离,对于每一个样本, 将其划分到与其距离最近的“簇中心”所在的簇中,对于新的簇计算各个簇的新的“簇中心”。
- 根据以上描述,我们大致可以猜测到实现kmeans算法的主要四点:
(1) 簇个数k的选择
(2) 各个样本点到“簇中心的距离
(3) 根据新划分的簇,更新"簇中心”
(4) 重复上述2、 3过程,直至"簇中心"没有移动
- 优缺点:
优点: 容易实现
缺点: 可能收敛到局部最小值, 在大规模数据上收敛较慢
- 步骤:
1、先定义总共有多少个类/簇【k的值可以自己指定】
2、将每个簇心,随机定在一个点上
3、将每一个簇找到其所有关联点的中心点(取每一个点坐标的平均值)
4、设置上述点为新的簇心
5、重复上述步骤,直到每个簇所拥有的点不变
文章图片
文章图片
- 计算每个点到簇心的距离,使用的是欧式距离(k-means算法是基于欧式距离的);此时是A1 A3 A5归为一类(蓝色),且A3是簇心;A2 A4 A6归为一类(紫色),且A4是簇心
- 分别计算蓝色和紫色类中的
avg(x)
和avg(y)
, 那作为新的簇心; - 计算每个点到新的簇心的距离,并且将距离近的归为一类。此时蓝色类和紫色类中的点还是原来的点,所以循环停止。
- 最后输出簇心以及类中其他的点
- K值 = 分为几类 = 簇组数量 = 质心数量 【由用户给出】
- 每次更新,K值保持不变
- 计算每个点与簇心之间距离的度量策略。
- 在欧式空间采用的是欧式距离,在处理文档中采用的是余弦相似度,有的时候也采用曼哈顿距离作为度量,不同情况度量方法不同。
- 对于分类之后产生的k个簇,分别计算簇内其他点距离均值最小的点作为质心
- 如果分类中的样本与上次分类结果一致,那么就停止k-means
dataset
是一个list
def createDataSet():
return [[1, 1], [1, 2], [2, 1], [6, 4], [6, 3], [5, 4]]if __name__ == '__main__':
dataset = createDataSet()# type(dataset)='list'
3.2 kmeans函数实现
- 作用:实现k-means算法
# k-means 算法实现
def kmeans(dataSet, k):
# (1) 随机选定k个质心
centroids = random.sample(dataSet, k)
print("输出两个质心", centroids)# (2) 计算样本值到质心之间的距离,直到质心的位置不再改变
changed, newCentroids = Update_cen(dataSet, centroids, k)
while np.any(changed):
changed, newCentroids = Update_cen(dataSet, centroids, k)centroids = sorted(newCentroids.tolist())# (3) 根据最终的质心,计算每个集群的样本
cluster = []
dis = Distance(dataSet, centroids, k)# 调用欧拉距离
minIndex = np.argmin(dis, axis=1)
for i in range(k):
cluster.append([])
for i, j in enumerate(minIndex):# enumerate()可同时遍历索引和遍历元素
cluster[j].append(dataSet[i])return centroids, cluster
3.2.1 random.sample(sequence, k)
表示从指定序列
sequence
中,随机获取k
个数据元素,随机排列,并以列表的形式返回。*注sample不会修改原有序列
- 例如代码:
dataset = [[1, 1], [1, 2], [2, 1], [6, 4], [6, 3], [5, 4]]
data = https://www.it610.com/article/random.sample(dataset, k=4)
print(data)
- 输出结果:
[[1, 2], [6, 4], [5, 4], [2, 1]]
3.2.2 np.all()
- 用于判断整个数组中的元素的值是否全部满足条件,如果满足条件返回
True
,否则返回Flase
- 任意一个元素为
True
,输出为True
。
- 作用:更新质心
- 求
data
在指定axis维度上最小值对应的位置索引(索引从0开始)。(若有多个相同的最小值,则返回第一个) data
可以是list类型,可以是array类型
a=np.array([[1, 5, 5, 2],
[9, 6, 2, 8],
[3, 7, 9, 1]])
min_a0 = np.argmin(a, axis=0)
min_a0
array([0, 0, 1, 2], dtype=int64)
min_a1 = np.argmin(a, axis=1)
min_a1
array([0, 2, 3], dtype=int64)
3.3.2 df.groupby().mean()
- 根据DataFrame的一个属性进行分组,然后求均值
newCentroids = pd.DataFrame(dataSet).groupby(minIndex).mean()
- 比如说上面代码,先把数据集按照minIndex索引分类,因为minIndex索引只有0和1,因此分为两类。
- 然后求每一个类中的均值,作为新的x和新的y
- 作用:计算欧式距离
# 计算欧式距离
def Distance(dataSet, centroids, k) -> np.array():
dis = []
for data in dataSet:
diff = np.tile(data, (k, 1)) - centroids# 行数上复制k份,方便作差
temp1 = diff ** 2
temp2 = np.sum(temp1, axis=1)# 按行相加
dis_temp = temp2 ** 0.5
dis.append(dis_temp)
dis = np.array(dis)# 转换为一个array类型
return dis
3.4.1 np.tile(data, (x, y))
- 此函数是扩展函数,data是要扩展的数据,类型为np类型数组,
x:扩展行数
,y:扩展列数
- 代码测试:
import numpy as np
arr1 = np.array([4, 2])
arr1
array([4, 2])
np.tile(arr1, (6, 1))
array([[4, 2],
[4, 2],
[4, 2],
[4, 2],
[4, 2],
[4, 2]])
np.tile(arr1, (6, 2))
array([[4, 2, 4, 2],
[4, 2, 4, 2],
[4, 2, 4, 2],
[4, 2, 4, 2],
[4, 2, 4, 2],
[4, 2, 4, 2]])
arr1
array([4, 2])
3.4.2 计算欧式距离
- 这里质心是
k=2
个,所以说需要np.tile()
函数复制k份,然后就可以一次性把每一个样本点到这k=2
个质心的欧式距离都算出来了。【k是用户指定值】
文章图片
【此公式适用于二维空间计算欧式距离,多维空间需要推广】
- 对应维度相减再求和,再开方。
文章图片
- 求和函数, axis默认为None,也就是求整个数组的和
- 指定axis=0按列求和,axis=1按行求和
import numpy as np
data = https://www.it610.com/article/np.arange(6).reshape(2, 3)
data
array([[0, 1, 2],
[3, 4, 5]])
np.sum(data)
15
np.sum(data, axis=0)
array([3, 5, 7])
np.sum(data, axis=1)
array([ 3, 12])
4 代码
import random
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt# 计算欧式距离
def Distance(dataSet, centroids, k) -> np.array:
dis = []
for data in dataSet:
diff = np.tile(data, (k, 1)) - centroids# 行数上复制k份,方便作差
temp1 = diff ** 2
temp2 = np.sum(temp1, axis=1)# 按行相加
dis_temp = temp2 ** 0.5
dis.append(dis_temp)
dis = np.array(dis)# 转换为一个array类型
return dis# 更新质心
def Update_cen(dataSet, centroids, k):
# 计算每个样本到质心的距离,返回值是array数组
distance = Distance(dataSet, centroids, k)
# print("输出所有样本到质心的距离:", distance)
# 分组并计算新的质心
minIndex = np.argmin(distance, axis=1)# axis=1 返回每行最小值的索引
# print("输出最小值索引", minIndex)
newCentroids = pd.DataFrame(dataSet).groupby(minIndex).mean()
# print("新的质心(dataframe):", newCentroids)
newCentroids = newCentroids.values
# print("新的质心(值):", newCentroids)# 计算变化量
changed = newCentroids - centroids
return changed, newCentroids# k-means 算法实现
def kmeans(dataSet, k):
# (1) 随机选定k个质心
centroids = random.sample(dataSet, k)
print("随机选定两个质心:", centroids)# (2) 计算样本值到质心之间的距离,直到质心的位置不再改变
changed, newCentroids = Update_cen(dataSet, centroids, k)
while np.any(changed):
changed, newCentroids = Update_cen(dataSet, newCentroids, k)
centroids = sorted(newCentroids.tolist())# (3) 根据最终的质心,计算每个集群的样本
cluster = []
dis = Distance(dataSet, centroids, k)# 调用欧拉距离
minIndex = np.argmin(dis, axis=1)
for i in range(k):
cluster.append([])
for i, j in enumerate(minIndex):# enumerate()可同时遍历索引和遍历元素
cluster[j].append(dataSet[i])return centroids, cluster# 创建数据集
def createDataSet():
return [[1, 1], [1, 2], [2, 1], [6, 4], [6, 3], [5, 4]]if __name__ == '__main__':
dataset = createDataSet()# type(dataset)='list'
centroids, cluster = kmeans(dataset, 2)# 2 代表的是分为2类=2个质心
print('质心为:%s' % centroids)
print('集群为:%s' % cluster)
# x = list(np.array(dataset).T[0])
# y = list(np.array(dataset).T[1])
plt.scatter(list(np.array(dataset).T[0]), list(np.array(dataset).T[1]), marker='o', color='green', label="数据集" )
plt.scatter(list(np.array(centroids).T[0]), list(np.array(centroids).T[1]), marker='x', color='red', label="质心")
plt.show()
【机器学习算法|K-means聚类算法原理及python具体实现】
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