GPflow解读—概述
什么是GPflow
GPflow是一个高斯过程的工具包,接口部分由python实现,内部的部分计算则由TensorFlow实现。
主要特点有二个:一是使用变分推理作为近似方法,二是使用自动微分进行求导。
安装
首先到GPflow官方页面将代码包下载到本地,然后进入代码包根目录,在终端输入pip install .
即可安装。
GPy 与 GPflow之间的区别
GPflow很多核心的类和方法都参考了GPy,不过GPflow使用TensorFlow使得代码及其简洁!
GPflow的模块
- GPflow 利用 TensorFlow 使得计算更快,适合更复杂的运算。
- GPflow 代码量比 GPy 少的多,因为使用 TensorFlow。
- GPflow 的推理部分实现了变分推理(VI)和MCMC,没有实现期望传播(EP)和拉普拉斯近似(Laplace approximation)。
- GPflow 没有支持画图模块。
GPflow.models
模块实现了主要的GP模型。
- Regression: GPflow支持高斯回归。对于噪音为高斯过程的情况,即最普通的高斯回归,在推理阶段可以直接通过解析表达式求,实现见
gpflow.models.GPR
。GPflow也支持稀疏高斯回归,实现见gpflow.models.SGPR
。- Variational inference: 通过变分推理方法,我们可以用高斯分布来估计隐函数的后验分布,实现见 [2]
gpflow.models.VGP
,[3]gpflow.models.SVGP
。- MCMC: 通过MCMC,我们可以对采样,然后求平均得到最终预测值。实现见
gpflow.models.GPMC
和gpflow.models.SGPMC
。
GPflow.params
模块是GPflow的基石之一。
Parameter
用来存储GP模型的各种参数,如协方差函数的length-scale参数。Parameterized
中存储了各种Parameter
,也定义了在这些Parameter
节点上的一系列运算。各种先验分布,协方差函数,GP模型都继承 了Parameterized
类。
最后,Matthews的博士论文[8]系统阐述了以上内容,可以作为更详细的参考。
GPflow.core
模块是关于tensorflow、自动求导等内容的。
参考文献 [1] MCMC for Variationally Sparse Gaussian Processes J Hensman, A G de G Matthews, M Filippone, Z Ghahramani Advances in Neural Information Processing Systems, 1639-1647, 2015.
[2] The variational Gaussian approximation revisited M Opper, C Archambeau Neural computation 21 (3), 786-792, 2009.
[3] Scalable Variational Gaussian Process Classification J Hensman, A G de G Matthews, Z Ghahramani Proceedings of AISTATS 18, 2015.
【GPflow解读—概述】[4] Variational Learning of Inducing Variables in Sparse Gaussian Processes. M Titsias Proceedings of AISTATS 12, 2009.
[5] On Sparse variational methods and the Kullback-Leibler divergence between stochastic processes A G de G Matthews, J Hensman, R E Turner, Z Ghahramani Proceedings of AISTATS 19, 2016.
[6] Gaussian process latent variable models for visualisation of high dimensional data. Lawrence, Neil D. Advances in Neural Information Processing Systems, 329-336, 2004.
[7] Bayesian Gaussian Process Latent Variable Model. Titsias, Michalis K., and Neil D. Lawrence. Proceedings of AISTATS, 2010.
[8] Scalable Gaussian process inference using variational methods. Alexander G. de G. Matthews. PhD Thesis. University of Cambridge, 2016.
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