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生物信息化|基因的哲学

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[b]勤俭节约是美德[/b]
相对于真核生物（高等动植物），原核生物（细菌等）表现得非常节俭，这是与他的生存环境分不开的。真核生物生存能力强，有的能够自己选择环境，比如说动物。而原核动物就没有这么好的生存条件了，成天饱一顿饿一顿，运气好时飘到垃圾堆里饱餐一顿，运气不好就饿肚子吧。于是他不得不节俭起来，连对待决定自己遗传和生存的基因也毫不手软，能简则简。基因是由碱基对组成的，每种生物都有4个碱基，即A，T，C，G。而编码氨基酸要由3个碱基完成。就这样3个一组组成了遗传密码。我们就将基因比作一本书，书上的字全是又A，T，C，G四个中的3个组成的，如ATG就是“好”字。当然在读书的时候有由几十个字母组成的开头，提示下面开始读了。原核生物的书，在提示以后就是一口气读下去，连个标点符号都没有。而真核生物是读几个字，有一个标记在下面提示“后面的不读了”，当读到“我们重新开始读”的标记的时候再开始读。这样算下来原核生物的书就比真核生物的书薄多了。8dD生物网站地图
相对于真核生物每2个编码区中间的没有编码意义的内含子（就是不读的部分），原核生物果断舍弃，秉承一条路走到黑的原则。所有的编码区首尾相连。当然这还不是最绝的，有些原核基因就通过移码的方式将一段基因藏到另一段基因里面，将吝啬发挥到了极致。就好比ATCGATCGATCG你从第一个读起就是ATC，GAT，CGA ，TCG。而有人告诉你第一个A不读从T开始就变成了TCG，ATC，GAT了。
做人又何尝不是这样，给你一本本子叫你写下一篇文章，纸张很少的时候为了把它写完，不打标点就不打吧，如果给你两本本子，你就可以打点标点，空两行也行啊。

[b]找对位置以后你才会与众不同[/b]
玉米的种子有好几种不同的颜色，通常有白色和紫色还有一种带有紫色的斑点。而玉米种子的颜色是由控制玉米胚乳中颜色合成的基因控制的。若玉米带有野生型C基因，则胚乳呈紫色，C基因的突变阻断了紫色素的合成，那么胚乳呈白色。在胚乳发育的过程中，突变发生回复（C基因的阻断被解除）导致斑点的产生。回复突变发生在早期发育阶段，那么这粒玉米就是紫色的，若是发生在中后期发育阶段，那么这粒玉米便会出现紫色的斑点。
这就好比是一只白母鸡生小鸡，小鸡长大后又生小鸡，而且小鸡的颜色和母鸡一样。如果一开始就是一只白色的母鸡，那么到最后这群鸡都是白色的。同理一开始母鸡是黑的，最后鸡群也是黑的。如果母鸡生的小鸡中有一只出了问题，变黑了，那么到最后，鸡群便是黑白相间的了。这就是为什么玉米种子有3种颜色的原因。
C突变是由一个解离因子（dissociator, Ds）引起的，它可插入到C基因中（即转座）。另一个可移动的控制因子是激活因子（activator，Ac），它的存在可激活Ds转座，进入C基因或其他基因，也能使Ds从基因中转出，使突变基因产生“回复突变”，这就是Ac-Ds系统。说白了就是一根水管被夹子夹住了，水流不通，你把夹子取下来夹到不是这根管子的地方，这根水管就通了。
其实人又何尝不是这样，你老是抱怨你不被人发现不被人赏识，你却从来不找找自己的原因。也许你就根本不适合这项工作，你却偏偏死占着这个地方。把眼界放开一点吧，懂得离开，懂得放弃，说不定你就会成就辉煌。其实你只不过是一个站错位置的解离因子Ds，当你离开这个地方以后你便会发现，你变成了那颗漂亮的紫色玉米。8dD生物网站地图

[b]一个人的出生虽然很重要，但并不是全部[/b]
在基因的表观遗传发现之前，人们是唯基因论，认为基因决定一切。正如一个人一出生就决定了他以后的命运一样。当基因的表观遗传发现以后，这个传统就被颠覆了。就通常来说一个合成蛋白质的基因它要表现出来，要通过好几个步骤。首先它要转录成为RNA，然后再翻译成为蛋白质，最后再进行蛋白质的剪切折叠才行。在这之间的每一个步骤，只要有一个出了问题，结果便会大不一样了。表观遗传（epigenetics）是指DNA序列不发生变化，但基因表达却发生了可遗传的改变。这种改变是细胞内除了遗传信息以外的其他可遗传物质发生的改变，且这种改变在发育和细胞增殖过程中能稳定传递。表观遗传的方式很多，在这里就简单介绍2种吧。一种叫做DNA甲基化，一种叫RNA干扰。前者是对基因中的RNA进行甲基化修饰来控制基因的表达。一般来说，被甲基化的基因它的转录能力会被限制住，到最后便不能产生相应的蛋白。人在胚胎时期的甲基化程度是最低的，随着年龄的成长甲基化程度便会逐渐增加。而人的饮食，环境都会对其产生影响，这就是为什么两个双胞胎在出生的时候差不多，当他们分开以后，过了几十年再聚在一起时便产生区别的原因。RNA干扰则是对基因转录产生的RNA进行降解导致其不能产生蛋白的过程，它是通过体外注射和目标RNA一样的双链RNA来实现的。而且这种现象还可以遗传给后代。

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