机器学习或者是日常生活中,遇见的往往是二分类问题比较多,二分类模型的模型评价准则很多,Auc_score,F1_score,accuracy等等都是比较常用的。而针对多分类问题来说,有些二分类的评价准则就相对而言不怎么适用了。虽然可以将多分类问题转化为多个2vs2问题进行讨论,步骤繁杂的同时效果也得不到保障。目前在进行多模态的一个分类研究,在模型评价时也废了不少脑筋,所以在这里将看到的比较常用的多分类评价准则进行整理,便于日后学习。
评价准则1:Kappa系数
Kappa系数是基于混淆矩阵的计算得到的模型评价参数。计算公式如下:
文章图片
系数的值在-1到1之间,系数小于0的话实际上就相当于随机了。
python实现为:
from sklearn.metrics import cohen_kappa_score
kappa = cohen_kappa_score(y_true,y_pred,label=None) #(label除非是你想计算其中的分类子集的kappa系数,否则不需要设置)
2.海明距离
海明距离也适用于多分类的问题,简单来说就是衡量预测标签与真实标签之间的距离,取值在0~1之间。距离为0说明预测结果与真实结果完全相同,距离为1就说明模型与我们想要的结果完全就是背道而驰。python实例。
from sklearn.metrics import hamming_loss
ham_distance = hamming_loss(y_true,y_pred)
3.杰卡德相似系数
它与海明距离的不同之处在于分母。当预测结果与实际情况完全相符时,系数为1;当预测结果与实际情况完全不符时,系数为0;当预测结果是实际情况的真子集或真超集时,距离介于0到1之间。
我们可以通过对所有样本的预测情况求平均得到算法在测试集上的总体表现情况。
from sklearn.metrics import jaccard_similarity_score
jaccrd_score = jaccrd_similarity_score(y_true,y_pred,normalize = default)
#normalize默认为true,这是计算的是多个类别的相似系数的平均值,normalize = false时分别计算各个类别的相似系数
4.铰链损失
铰链损失(Hinge loss)一般用来使“边缘最大化”(maximal margin)。损失取值在0~1之间,当取值为0,表示多分类模型分类完全准确,取值为1表明完全不起作用。
from sklearn.metrics import hinge_loss
hinger = hinger_loss(y_true,y_pred)
链接:https://www.cnblogs.com/harvey888/p/6964741.html
sklearn中的模型评估-构建评估函数
1.介绍
有三种不同的方法来评估一个模型的预测质量:
estimator的score方法:sklearn中的estimator都具有一个score方法,它提供了一个缺省的评估法则来解决问题。
Scoring参数:使用cross-validation的模型评估工具,依赖于内部的scoring策略。见下。
Metric函数:metrics模块实现了一些函数,用来评估预测误差。见下。
2. scoring参数
模型选择和评估工具,例如: grid_search.GridSearchCV 和 cross_validation.cross_val_score,使用scoring参数来控制你的estimator的好坏。
2.1 预定义的值
对于大多数case而说,你可以设计一个使用scoring参数的scorer对象;下面展示了所有可能的值。所有的scorer对象都遵循:高得分,更好效果。如果从mean_absolute_error 和mean_squared_error(它计算了模型与数据间的距离)返回的得分将被忽略。
2.2 从metric函数定义你的scoring策略
sklearn.metric提供了一些函数,用来计算真实值与预测值之间的预测误差:
以_score结尾的函数,返回一个最大值,越高越好
以_error结尾的函数,返回一个最小值,越小越好;如果使用make_scorer来创建scorer时,将greater_is_better设为False
接下去会讨论多种机器学习当中的metrics。
许多metrics并没有给出在scoring参数中可配置的字符名,因为有时你可能需要额外的参数,比如:fbeta_score。这种情况下,你需要生成一个合适的scorer对象。最简单的方法是调用make_scorer来生成scoring对象。该函数将metrics转换成在模型评估中可调用的对象。
第一个典型的用例是,将一个库中已经存在的metrics函数进行包装,使用定制参数,比如对fbeta_score函数中的beta参数进行设置:
你可以使用python函数:下例中的my_custom_loss_funcfrom sklearn.metrics import fbeta_score, make_scorer
ftwo_scorer = make_scorer(fbeta_score, beta=2)
from sklearn.grid_search import GridSearchCV
from sklearn.svm import LinearSVC
grid = GridSearchCV(LinearSVC(), param_grid={‘C’: [1, 10]}, scoring=ftwo_scorer)
第二个典型用例是,通过make_scorer构建一个完整的定制scorer函数,该函数可以带有多个参数:
python函数是否返回一个score(greater_is_better=True),还是返回一个loss(greater_is_better=False)。如果为loss,python函数的输出将被scorer对象忽略,根据交叉验证的原则,得分越高模型越好。
对于分类问题的metrics:如果你提供的python函数是否需要对连续值进行决策判断,可以将参数设置为(needs_threshold=True)。缺省值为False。
一些额外的参数:比如f1_score中的bata或labels。
下例使用定制的scorer,使用了greater_is_better参数:
import numpy as np
def my_custom_loss_func(ground_truth, predictions):
… diff = np.abs(ground_truth - predictions).max()
… return np.log(1 + diff)
…
必须可以用(estimator, X, y)进行调用loss = make_scorer(my_custom_loss_func, greater_is_better=False)
score = make_scorer(my_custom_loss_func, greater_is_better=True)
ground_truth = [[1, 1]]
predictions = [0, 1]
from sklearn.dummy import DummyClassifier
clf = DummyClassifier(strategy=‘most_frequent’, random_state=0)
clf = clf.fit(ground_truth, predictions)
loss(clf,ground_truth, predictions)
-0.69…
score(clf,ground_truth, predictions)
0.69…
2.3 实现你自己的scoring对象
你可以生成更灵活的模型scorer,通过从头构建自己的scoring对象来完成,不需要使用make_scorer工厂函数。对于一个自己实现的scorer来说,它需要遵循两个原则:
必须返回一个float的值
3. 分类metrics
sklearn.metrics模块实现了一些loss, score以及一些工具函数来计算分类性能。一些metrics可能需要正例、置信度、或二分决策值的的概率估计。大多数实现允许每个sample提供一个对整体score来说带权重的分布,通过sample_weight参数完成。
一些二分类(binary classification)使用的case:
matthews_corrcoef(y_true, y_pred)
precision_recall_curve(y_true, probas_pred)
roc_curve(y_true, y_score[, pos_label, …])
一些多分类(multiclass)使用的case:
confusion_matrix(y_true, y_pred[, labels])
hinge_loss(y_true, pred_decision[, labels, …])
一些多标签(multilabel)的case:
accuracy_score(y_true, y_pred[, normalize, …])
classification_report(y_true, y_pred[, …])
f1_score(y_true, y_pred[, labels, …])
fbeta_score(y_true, y_pred, beta[, labels, …])
hamming_loss(y_true, y_pred[, classes])
jaccard_similarity_score(y_true, y_pred[, …])
log_loss(y_true, y_pred[, eps, normalize, …])
precision_recall_fscore_support(y_true, y_pred)
precision_score(y_true, y_pred[, labels, …])
recall_score(y_true, y_pred[, labels, …])
zero_one_loss(y_true, y_pred[, normalize, …])
还有一些可以同时用于二标签和多标签(不是多分类)问题:
average_precision_score(y_true, y_score[, …])
roc_auc_score(y_true, y_score[, average, …])
在以下的部分,我们将讨论各个函数。
3.1 二分类/多分类/多标签
对于二分类来说,必须定义一些matrics(f1_score,roc_auc_score)。在这些case中,缺省只评估正例的label,缺省的正例label被标为1(可以通过配置pos_label参数来完成)
将一个二分类matrics拓展到多分类或多标签问题时,我们可以将数据看成多个二分类问题的集合,每个类都是一个二分类。接着,我们可以通过跨多个分类计算每个二分类metrics得分的均值,这在一些情况下很有用。你可以使用average参数来指定。
macro:计算二分类metrics的均值,为每个类给出相同权重的分值。当小类很重要时会出问题,因为该macro-averging方法是对性能的平均。另一方面,该方法假设所有分类都是一样重要的,因此macro-averaging方法会对小类的性能影响很大。
weighted: 对于不均衡数量的类来说,计算二分类metrics的平均,通过在每个类的score上进行加权实现。
micro: 给出了每个样本类以及它对整个metrics的贡献的pair(sample-weight),而非对整个类的metrics求和,它会每个类的metrics上的权重及因子进行求和,来计算整个份额。Micro-averaging方法在多标签(multilabel)问题中设置,包含多分类,此时,大类将被忽略。
samples:应用在 multilabel问题上。它不会计算每个类,相反,它会在评估数据中,通过计算真实类和预测类的差异的metrics,来求平均(sample_weight-weighted)
average:average=None将返回一个数组,它包含了每个类的得分.
多分类(multiclass)数据提供了metric,和二分类类似,是一个label的数组,而多标签(multilabel)数据则返回一个索引矩阵,当样本i具有label j时,元素[i,j]的值为1,否则为0.
3.2 accuracy_score
accuracy_score函数计算了准确率,不管是正确预测的fraction(default),还是count(normalize=False)。
在multilabel分类中,该函数会返回子集的准确率。如果对于一个样本来说,必须严格匹配真实数据集中的label,整个集合的预测标签返回1.0;否则返回0.0.
预测值与真实值的准确率,在n个样本下的计算公式如下:
1(x)为指示函数。
import numpy as np
from sklearn.metrics import accuracy_score
y_pred = [0, 2, 1, 3]
y_true = [0, 1, 2, 3]
accuracy_score(y_true, y_pred)
0.5
accuracy_score(y_true, y_pred, normalize=False)
2
在多标签的case下,二分类label:
kappa score是一个介于(-1, 1)之间的数. score>0.8意味着好的分类;0或更低意味着不好(实际是随机标签)accuracy_score(np.array([[0, 1], [1, 1]]), np.ones((2, 2)))
0.5
3.3 Cohen’s kappa
函数cohen_kappa_score计算了Cohen’s kappa估计。这意味着需要比较通过不同的人工标注(numan annotators)的标签,而非分类器中正确的类。
Kappa score可以用在二分类或多分类问题上,但不适用于多标签问题,以及超过两种标注的问题。
3.4 混淆矩阵
confusion_matrix函数通过计算混淆矩阵,用来计算分类准确率。
缺省的,在混淆矩阵中的i,j指的是观察的数目i,预测为j,示例:
示例:from sklearn.metrics import confusion_matrix
y_true = [2, 0, 2, 2, 0, 1]
y_pred = [0, 0, 2, 2, 0, 2]
confusion_matrix(y_true, y_pred)
array([[2, 0, 0],
[0, 0, 1],
[1, 0, 2]])
结果为:
Confusion matrix
Recognizing hand-written digits
Classification of text documents using sparse features
3.5 分类报告
classification_report函数构建了一个文本报告,用于展示主要的分类metrics。 下例给出了一个小示例,它使用定制的target_names和对应的label:
from sklearn.metrics import classification_report
y_true = [0, 1, 2, 2, 0]
y_pred = [0, 0, 2, 2, 0]
target_names = [‘class 0’, ‘class 1’, ‘class 2’]
print(classification_report(y_true, y_pred, target_names=target_names))
precision recall f1-score support
class 00.671.000.802
class 10.000.000.001
class 21.001.001.002
avg / total 0.67 0.80 0.72 5
示例:
识别手写数字示例
使用sparse特征的文本分类
使用grid search的cross-validation的参数估计
3.6 Hamming loss
hamming_loss计算了在两个样本集里的平均汉明距离或平均Hamming loss。
是对应第j个label的预测值,
是对应的真实值
是类目数
那么两个样本间的Hamming loss为,定义如下:
其中:为指示函数。
from sklearn.metrics import hamming_loss
y_pred = [1, 2, 3, 4]
y_true = [2, 2, 3, 4]
hamming_loss(y_true, y_pred)
0.25
在多标签(multilabel)的使用二元label指示器的情况:
3.7 Jaccard相似度系数scorehamming_loss(np.array([[0, 1], [1, 1]]), np.zeros((2, 2)))
0.75
注意:在多分类问题上,Hamming loss与y_true 和 y_pred 间的Hamming距离相关,它与0-1 loss相类似。然而,0-1 loss会对不严格与真实数据集相匹配的预测集进行惩罚。因而,Hamming loss,作为0-1 loss的上界,也在0和1之间;预测一个合适的真实label的子集或超集将会给出一个介于0和1之间的Hamming loss.
jaccard_similarity_score函数会计算两对label集之间的Jaccard相似度系数的平均(缺省)或求和。它也被称为Jaccard index.
第i个样本的Jaccard相似度系数(Jaccard similarity coefficient),真实标签集为,预测标签集为:,其定义如下:
在二分类和多分类问题上,Jaccard相似度系数score与分类的正确率(accuracy)相同:
import numpy as np
from sklearn.metrics import jaccard_similarity_score
y_pred = [0, 2, 1, 3]
y_true = [0, 1, 2, 3]
jaccard_similarity_score(y_true, y_pred)
0.5
jaccard_similarity_score(y_true, y_pred, normalize=False)
2
在多标签(multilabel)问题上,使用二元标签指示器:
F-meature(包括:和),可以认为是precision和recall的加权调和平均(weighted harmonic mean)。一个值,最佳为1,最差时为0. 如果=1,那么和相等,precision和recall的权重相等。jaccard_similarity_score(np.array([[0, 1], [1, 1]]), np.ones((2, 2)))
0.75
3.8 准确率,召回率与F值
准确率(precision)可以衡量一个样本为负的标签被判成正,召回率(recall)用于衡量所有正例。
precision_recall_curve会根据预测值和真实值来计算一条precision-recall典线。
average_precision_score则会预测值的平均准确率(AP: average precision)。该分值对应于precision-recall曲线下的面积。
sklearn提供了一些函数来分析precision, recall and F-measures值:
average_precision_score:计算预测值的AP
f1_score: 计算F1值,也被称为平衡F-score或F-meature
fbeta_score: 计算F-beta score
precision_recall_curve:计算不同概率阀值的precision-recall对
precision_recall_fscore_support:为每个类计算precision, recall, F-measure 和 support
precision_score: 计算precision
recall_score: 计算recall
注意:precision_recall_curve只用于二分类中。而average_precision_score可用于二分类或multilabel指示器格式
示例:
使用sparse特性的文档分类
使用grid search corss-validation的参数估计
Precision-Recall
Sparse recovery: feature selection for sparse linear models
3.8.1 二分类
在二元分类中,术语“positive”和“negative”指的是分类器的预测类别(expectation),术语“true”和“false”则指的是预测是否正确(有时也称为:观察observation)。给出如下的定义:
实际类目(observation)
预测类目(expectation) TP(true positive)结果:Correct FP(false postive)结果:Unexpected
FN(false negative)结果: Missing TN(true negtive)结果:Correct
在这个上下文中,我们定义了precision, recall和F-measure:
这里是一个二元分类的示例:
from sklearn import metrics
y_pred = [0, 1, 0, 0]
y_true = [0, 1, 0, 1]
metrics.precision_score(y_true, y_pred)
1.0
metrics.recall_score(y_true, y_pred)
0.5
metrics.f1_score(y_true, y_pred)
0.66…
metrics.fbeta_score(y_true, y_pred, beta=0.5)
0.83…
metrics.fbeta_score(y_true, y_pred, beta=1)
0.66…
metrics.fbeta_score(y_true, y_pred, beta=2)
0.55…
metrics.precision_recall_fscore_support(y_true, y_pred, beta=0.5)
(array([ 0.66…, 1. ]), array([ 1. , 0.5]), array([ 0.71…, 0.83…]), array([2, 2]…))
【多分类问题评价指标】注意:import numpy as np
from sklearn.metrics import precision_recall_curve
from sklearn.metrics import average_precision_score
y_true = np.array([0, 0, 1, 1])
y_scores = np.array([0.1, 0.4, 0.35, 0.8])
precision, recall, threshold = precision_recall_curve(y_true, y_scores)
precision
array([ 0.66…, 0.5 , 1. , 1. ])
recall
array([ 1. , 0.5, 0.5, 0. ])
threshold
array([ 0.35, 0.4 , 0.8 ])
average_precision_score(y_true, y_scores)
0.79…
3.8.2 多元分类和多标签分类
在多分类(Multiclass)和多标签(multilabel)分类问题上,precision, recall, 和 F-measure的概念可以独立应用到每个label上。有一些方法可以综合各标签上的结果,通过指定average_precision_score (只能用在multilabel上), f1_score, fbeta_score, precision_recall_fscore_support, precision_score 和 recall_score这些函数上的参数average可以做到。
“micro”选项:表示在多分类中的对所有label进行micro-averaging产生一个平均precision,recall和F值
“weighted”选项:表示会产生一个weighted-averaging的F值。
可以考虑下面的概念:
y是(sample, label)pairs的预测集
是(sample, label)pairs的真实集
L是labels的集
S是labels的集
是y的子集,样本s,比如:
表示label l的y子集
同样的,和都是的子集
在处理时方式更不同;该实现采用,且与P相类似。
metrics的定义如下:
代码:
from sklearn import metrics
y_true = [0, 1, 2, 0, 1, 2]
y_pred = [0, 2, 1, 0, 0, 1]
metrics.precision_score(y_true, y_pred, average=‘macro’)
0.22…
metrics.recall_score(y_true, y_pred, average=‘micro’)
…
0.33…
metrics.f1_score(y_true, y_pred, average=‘weighted’)
0.26…
metrics.fbeta_score(y_true, y_pred, average=‘macro’, beta=0.5)
0.23…
metrics.precision_recall_fscore_support(y_true, y_pred, beta=0.5, average=None)
…
(array([ 0.66…, 0. , 0. ]), array([ 1., 0., 0.]), array([ 0.71…, 0. , 0. ]), array([2, 2, 2]…))
对于多分类问题,对于一个“negative class”,有可能会排除一些标签:
metrics.recall_score(y_true, y_pred, labels=[1, 2], average=‘micro’)
… # excluding 0, no labels were correctly recalled
0.0
类似的,在数据集样本中没有出现的label不能用在macro-averaging中。
如果label使用+1和-1进行编码。y为真实值,w为由decision_function结出的预测决策。 hinge loss的定义如下:metrics.precision_score(y_true, y_pred, labels=[0, 1, 2, 3], average=‘macro’)
…
0.166…
3.9 Hinge loss
hinge_loss函数会使用hinge loss计算模型与数据之间的平均距离。它是一个单边的metric,只在预测错误(prediction erros)时考虑。(Hinge loss被用于最大间隔分类器上:比如SVM)
如果超过两个label,由于Crammer & Singer所提到的问题 ,hinge_loss 会使用一个多元分类的变种。
如果是对于true label的预测判断(predicted decision),则是对于其他label的预测判断的最大值,而predicted decisions由多个predicted decision输出,那么多分类的hinge loss定义如下:
二分类问题示例:
from sklearn import svm
from sklearn.metrics import hinge_loss
X = [[0], [1]]
y = [-1, 1]
est = svm.LinearSVC(random_state=0)
est.fit(X, y)
LinearSVC(C=1.0, class_weight=None, dual=True, fit_intercept=True,
intercept_scaling=1, loss=‘squared_hinge’, max_iter=1000,
multi_class=‘ovr’, penalty=‘l2’, random_state=0, tol=0.0001,
verbose=0)
pred_decision = est.decision_function([[-2], [3], [0.5]])
pred_decision
array([-2.18…, 2.36…, 0.09…])
hinge_loss([-1, 1, 1], pred_decision)
0.3…
多分类问题示例:
对于二元分类,true label为:,概率估计为:,每个样本的log loss是对分类器给定true label的负值log似然估计(negative log-likelihood):X = np.array([[0], [1], [2], [3]])
Y = np.array([0, 1, 2, 3])
labels = np.array([0, 1, 2, 3])
est = svm.LinearSVC()
est.fit(X, Y)
LinearSVC(C=1.0, class_weight=None, dual=True, fit_intercept=True,
intercept_scaling=1, loss=‘squared_hinge’, max_iter=1000,
multi_class=‘ovr’, penalty=‘l2’, random_state=None, tol=0.0001,
verbose=0)
pred_decision = est.decision_function([[-1], [2], [3]])
y_true = [0, 2, 3]
hinge_loss(y_true, pred_decision, labels)
0.56…
3.10 Log loss
Log loss也被称为logistic回归loss,或者交叉熵loss(cross-entropy loss),用于概率估计。它通常用在(multinomial)的LR和神经网络上,以最大期望(EM:expectation-maximization)的变种的方式,用于评估一个分类器的概率输出,而非进行离散预测。
当扩展到多元分类(multiclass)上时。可以将样本的true label编码成1-of-K个二元指示器矩阵Y,如果从label K集合中取出的样本i,对应的label为k,则,P为概率估计矩阵,。整个集合的log loss表示如下:
我们再看下如何对二分类的log loss进行泛化的,注意,在二分类问题上, 和,因而,通过在扩展内部和来给出二分类的log loss。
log_loss函数,通过给定一列真实值label和一个概率矩阵来计算log loss,返回值通过estimator的predict_proba返回。
3.11 Matthews相关系数from sklearn.metrics import log_loss
y_true = [0, 0, 1, 1]
y_pred = [[.9, .1], [.8, .2], [.3, .7], [.01, .99]]
log_loss(y_true, y_pred)
0.1738…
y_pred中的[.9, .1]指的是,第一个样本中90%的概率是label 0。另外,log loss是非负的。
matthews_corrcoef函数计算了二元分类的Matthew’s correlation coefficient (MCC).
wikipedia是这么说的:
“The Matthews correlation coefficient is used in machine learning as a measure of the quality of binary (two-class) classifications. It takes into account true and false positives and negatives and is generally regarded as a balanced measure which can be used even if the classes are of very different sizes. The MCC is in essence a correlation coefficient value between -1 and +1. A coefficient of +1 represents a perfect prediction, 0 an average random prediction and -1 an inverse prediction. The statistic is also known as the phi coefficient.”
翻译如下:
机器学习中使用的Matthews相关系数,用于度量二分类的质量。它会考虑TP/FP/TN/FP的情况,通常被认为是一个balanced的度量 ,可以用于那些有着不同size的分类中。MCC本质上是一个介于[-1,+1]之间的相关系数值。相关系数为+1,表示是一个完美的预测,0表示是一个平均随机预测(average random prediction),而-1表示是一个逆预测(inverse prediction)。这种统计方法也被称为:phi coefficient。
MCC相应的定义如下:
这里的示例展示了matthews_corrcoef 函数的使用:
“A receiver operating characteristic (ROC), or simply ROC curve, is a graphical plot which illustrates the performance of a binary classifier system as its discrimination threshold is varied. It is created by plotting the fraction of true positives out of the positives (TPR = true positive rate) vs. the fraction of false positives out of the negatives (FPR = false positive rate), at various threshold settings. TPR is also known as sensitivity, and FPR is one minus the specificity or true negative rate.”from sklearn.metrics import matthews_corrcoef
y_true = [+1, +1, +1, -1]
y_pred = [+1, -1, +1, +1]
matthews_corrcoef(y_true, y_pred)
-0.33…
3.12 ROC
roc_curve计算了ROC曲线。Wikipedia如下:
该函数需要二分类的真实值和预测值,它可以是正例的概率估计,置信值,或二分决策值。下例展示了如何使用:
roc_auc_score函数计算了ROC曲线下面的面积,它也被称为AUC或AUROC。通过计算下面的面积,曲线信息被归一化到1内。import numpy as np
from sklearn.metrics import roc_curve
y = np.array([1, 1, 2, 2])
scores = np.array([0.1, 0.4, 0.35, 0.8])
fpr, tpr, thresholds = roc_curve(y, scores, pos_label=2)
fpr
array([ 0. , 0.5, 0.5, 1. ])
tpr
array([ 0.5, 0.5, 1. , 1. ])
thresholds
array([ 0.8 , 0.4 , 0.35, 0.1 ])
下图展下了上面的结果:
对比于其它metrics: accuracy、 Hamming loss、 F1-score, ROC不需要为每个label优化一个阀值。roc_auc_score函数也可以用于多分类(multi-class)问题上。如果预测的输出已经被二值化。import numpy as np
from sklearn.metrics import roc_auc_score
y_true = np.array([0, 0, 1, 1])
y_scores = np.array([0.1, 0.4, 0.35, 0.8])
roc_auc_score(y_true, y_scores)
0.75
在多标签(multi-label)分类上,roc_auc_score通过对上面的label进行平均。
示例:
Receiver Operating Characteristic (ROC)
Receiver Operating Characteristic (ROC) with cross validation
Species distribution modeling
3.13 0-1 loss
zero_one_loss会通过在计算0-1分类的)的平值或求和。缺省情况下,该函数会对样本进行归一化。为了得到的求和,需要将normalize设置为False。
在multilabel分类上,如果一个子集的labels与预测值严格匹配,zero_one_loss会得到1,如果有许多错误,则为0。缺省的,该函数会返回有问题的预测子集(不等)的百分比。为了得到这样的子集数,可以将normalize置为False。
如果是第i个样本的预测值, 是第i个样本的真实值,那么0-1 loss的定义如下:
其中1(x)表示的是指示函数。
from sklearn.metrics import zero_one_loss
y_pred = [1, 2, 3, 4]
y_true = [2, 2, 3, 4]
zero_one_loss(y_true, y_pred)
0.25
zero_one_loss(y_true, y_pred, normalize=False)
1
在多标签的问题上,如果使用二元标签指示器,第一个标签集[0,1]具有一个error:
zero_one_loss(np.array([[0, 1], [1, 1]]), np.ones((2, 2)))
0.5
Recursive feature elimination with cross-validationzero_one_loss(np.array([[0, 1], [1, 1]]), np.ones((2, 2)), normalize=False)
1
示例:
4. Multilabel的ranking metrics
在多标签学习上,每个样本都具有多个真实值label与它对应。它的目的是,为真实值label得到最高分或者最好的rank。
4.1 范围误差(Coverage error)
coverage_error计算了那些必须在最终预测(所有真实的label都会被预测)中包含的labels的平均数目。如果你想知道有多少top高分labels(top-scored-labels)时它会很有用,你必须以平均的方式进行预测,不漏过任何一个真实label。该metrics的最优值是对真实label求平均。
给定一个真实label的二分类指示矩阵:
以及每个label相关的分值: ,
相应的范围误差定义如下:
其中:。给定rank定义,通过给出最大的rank,来打破y_scores。
示例如下:
LRAP会对每个样本上分配的真实label进行求平均,真实值的比例 vs. 低分值labels的总数。如果你可以为每个样本相关的label给出更好的rank,该指标将产生更好的分值。得到的score通常都会比0大,最佳值为1。如果每个样本都只有一个相关联的label,那么LRAP就与平均倒数排名:mean reciprocal rankimport numpy as np
from sklearn.metrics import coverage_error
y_true = np.array([[1, 0, 0], [0, 0, 1]])
y_score = np.array([[0.75, 0.5, 1], [1, 0.2, 0.1]])
coverage_error(y_true, y_score)
2.5
4.2 Label ranking平均准确率
label_ranking_average_precision_score函数实现了Label ranking平均准确率 :LRAP(label ranking average precision)。该metric与average_precision_score有关联,但它基于label ranking的概念,而非precision/recall。
给定一个true label的二元指示矩阵,,每个label相对应的分值:,平均准确率的定义如下:
其中:
,
是l0 范式或是数据集的基数。
该函数的示例:
给定一个true labels的二元指示矩阵:,每个label相关的分值为:,ranking loss的定义如下:import numpy as np
from sklearn.metrics import label_ranking_average_precision_score
y_true = np.array([[1, 0, 0], [0, 0, 1]])
y_score = np.array([[0.75, 0.5, 1], [1, 0.2, 0.1]])
label_ranking_average_precision_score(y_true, y_score)
0.416…
4.3 Ranking loss
label_ranking_loss函数用于计算ranking loss,它会对label对没有正确分配的样本进行求平均。例如:true labels的分值比false labels的分值小,或者对true/false label进行了相反的加权。最低的ranking loss为0.
其中 为l0范式或数据集基数。
示例:
import numpy as np
from sklearn.metrics import label_ranking_loss
y_true = np.array([[1, 0, 0], [0, 0, 1]])
y_score = np.array([[0.75, 0.5, 1], [1, 0.2, 0.1]])
label_ranking_loss(y_true, y_score)
0.75…
mean_squared_error,y_score = np.array([[1.0, 0.1, 0.2], [0.1, 0.2, 0.9]])
label_ranking_loss(y_true, y_score)
0.0
5.回归metrics
sklearn.metrics 实现了许多种loss, score,untility函数来测评回归的性能。其中有一些可以作了增加用于处理多输出(multioutput)的情况:
mean_absolute_error
explained_variance_score
r2_score
这些函数具有一个multioutput关键参数,它指定了对于每一个单独的target是否需要对scores/loss进行平均。缺省值为’uniform_average’,它会对结果进行均匀加权平均。如果输出的ndarray的shape为(n_outputs,),那么它们返回的entries为权重以及相应的平均权重。如果multioutput参数为’raw_values’,那么所有的scores/losses都不改变,以raw的方式返回一个shape为(n_outputs,)的数组。
r2_score和explained_variance_score 对于multioutput参数还接受另一个额外的值:’variance_weighted’。该选项将通过相应target变量的variance产生一个为每个单独的score加权的值。该设置将会对全局捕获的未归一化的variance进行量化。如果target的variance具有不同的规模(scale),那么该score将会把更多的重要性分配到那些更高的variance变量上。
对于r2_score的缺省值为multioutput=’variance_weighted’,向后兼容。后续版本会改成uniform_average。
5.1 可释方差值(Explained variance score)
explained_variance_score解释了explained variance regression score
如果是估计的target输出,y为相应的真实(correct)target输出,Var为求方差(variance),即标准差的平方,那么可释方差(explained variance)的估计如下:
最好的可能值为1.0,越低表示越差。
示例如下:
如果是第i个样本的预测值,yi是相应的真实值,那么在上的平均绝对误差(MAE)的定义如下:from sklearn.metrics import explained_variance_score
y_true = [3, -0.5, 2, 7]
y_pred = [2.5, 0.0, 2, 8]
explained_variance_score(y_true, y_pred)
0.957…
y_true = [[0.5, 1], [-1, 1], [7, -6]]
y_pred = [[0, 2], [-1, 2], [8, -5]]
explained_variance_score(y_true, y_pred, multioutput=‘raw_values’)
…
array([ 0.967…, 1. ])
explained_variance_score(y_true, y_pred, multioutput=[0.3, 0.7])
…
0.990…
5.2 平均绝对误差(Mean absolute error)
mean_absolute_error函数将会计算平均绝对误差,该指标对应于绝对误差loss(absolute error loss)或l1范式loss(l1-norm loss)的期望值。
示例:
示例为:from sklearn.metrics import mean_absolute_error
y_true = [3, -0.5, 2, 7]
y_pred = [2.5, 0.0, 2, 8]
mean_absolute_error(y_true, y_pred)
0.5
y_true = [[0.5, 1], [-1, 1], [7, -6]]
y_pred = [[0, 2], [-1, 2], [8, -5]]
mean_absolute_error(y_true, y_pred)
0.75
mean_absolute_error(y_true, y_pred, multioutput=‘raw_values’)
array([ 0.5, 1. ])
mean_absolute_error(y_true, y_pred, multioutput=[0.3, 0.7])
…
0.849…
5.3 均方误差(Mean squared error)
mean_squared_error用于计算平均平方误差,该指标对应于平方(二次方)误差loss(squared (quadratic) error loss)的期望值。
Gradient Boosting regressionfrom sklearn.metrics import mean_squared_error
y_true = [3, -0.5, 2, 7]
y_pred = [2.5, 0.0, 2, 8]
mean_squared_error(y_true, y_pred)
0.375
y_true = [[0.5, 1], [-1, 1], [7, -6]]
y_pred = [[0, 2], [-1, 2], [8, -5]]
mean_squared_error(y_true, y_pred)
0.7083…
示例:
5.4 中值绝对误差(Median absolute error)
median_absolute_error是很令人感兴趣的,它对异类(outliers)的情况是健壮的。该loss函数通过计算target和prediction间的绝对值,然后取中值得到。
MedAE的定义如下:
median_absolute_error不支持multioutput。
示例:
R2的定义如下:from sklearn.metrics import median_absolute_error
y_true = [3, -0.5, 2, 7]
y_pred = [2.5, 0.0, 2, 8]
median_absolute_error(y_true, y_pred)
0.5
5.5 R方值,确定系数
r2_score函数用于计算R2(确定系数:coefficient of determination)。它用来度量未来的样本是否可能通过模型被很好地预测。分值为1表示最好,它可以是负数(因为模型可以很糟糕)。一个恒定的模型总是能预测y的期望值,忽略掉输入的feature,得到一个R^2为0的分值。
其中:
示例:
Lasso and Elastic Net for Sparse Signalsfrom sklearn.metrics import r2_score
y_true = [3, -0.5, 2, 7]
y_pred = [2.5, 0.0, 2, 8]
r2_score(y_true, y_pred)
0.948…
y_true = [[0.5, 1], [-1, 1], [7, -6]]
y_pred = [[0, 2], [-1, 2], [8, -5]]
r2_score(y_true, y_pred, multioutput=‘variance_weighted’)
…
0.938…
y_true = [[0.5, 1], [-1, 1], [7, -6]]
y_pred = [[0, 2], [-1, 2], [8, -5]]
r2_score(y_true, y_pred, multioutput=‘uniform_average’)
…
0.936…
r2_score(y_true, y_pred, multioutput=‘raw_values’)
…
array([ 0.965…, 0.908…])
r2_score(y_true, y_pred, multioutput=[0.3, 0.7])
…
0.925…
示例:
6.聚类metrics
sklearn.metrics也提供了聚类的metrics。更多细节详见:
Clustering performance evaluation
Biclustering evaluation
7. Dummy estimators
当进行监督学习时,一个简单明智的check包括:使用不同的规则比较一个estimator。DummyClassifier实现了三种简单的策略用于分类:
stratified:根据训练集的分布来生成随机预测
most_frequent:在训练集中总是预测最频繁的label
prior:总是预测分类最大化分类优先权(比如:most_frequent),predict_proba返回分类优化权
uniform:以均匀方式随机生成预测
constant:由用户指定,总是预测一个常量的label。该方法的一个最主要动机是:F1-scoring,其中正例是最主要的。
注意,所有的这些策略中,predict方法会完成忽略输入数据!
示例,我们首先创建一个imbalanced的数据集:
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.cross_validation import train_test_split
iris = load_iris()
X, y = iris.data, iris.target
y[y != 1] = -1
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, random_state=0)
下一步,比较下SVC的accuary和most_frequent:
from sklearn.dummy import DummyClassifier
from sklearn.svm import SVC
clf = SVC(kernel=‘linear’, C=1).fit(X_train, y_train)
clf.score(X_test, y_test)
0.63…
clf = DummyClassifier(strategy=‘most_frequent’,random_state=0)
clf.fit(X_train, y_train)
DummyClassifier(constant=None, random_state=0, strategy=‘most_frequent’)
clf.score(X_test, y_test)
0.57…
我们可以看到SVC并不比DummyClassifier好很多,接着,我们换下kernel:
更一般的,分类器的accuracy太接近于随机,这可能意味着有可能会出问题:features没有用,超参数没有被正确设置,分类器所用的数据集imbalance,等等。。。clf = SVC(kernel=‘rbf’, C=1).fit(X_train, y_train)
clf.score(X_test, y_test)
0.97…
我们可以看到,accuracy增强到了几乎100%。如果CPU开销不大,这里建议再做下cross-validation。如果你希望在参数空间进行优化,我们强烈推荐你使用GridSearchCV。
DummyRegressor也实现了4种简单的方法:
mean:通常预测训练target的均值。
median:通常预测训练target的中值。
quantile:预测由用户提供的训练target的分位数
constant:常量
在上面的所有策略,predict完全忽略输入数据
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