1、天然的提取物不同：山莨菪碱由唐古特莨碱提取，东莨菪碱由洋金花提取 。
2、化学结构不同：东莨菪碱为左旋体，山莨为右旋体或消旋体，左旋比右旋体的作用强 。
【山莨菪碱和东莨菪碱有什么不同】3、在抗M胆碱受体的作用选择性不同：山莨菪碱与阿托品相似，对腺体，眼，平滑肌及心肌的作用强 ， 但对唾液及扩瞳和中枢神经作用要弱 。东莨菪碱主要表现较强的是中枢神经，经常用于预防晕车 。
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