三、享受待遇不同
副科长享受副科级领导相关待遇，而副主任科员只享受科员的待遇 。
扩展资料：
《中华人民共和国公务员法》第十六条规定：“公务员职务分为领导职务和非领导职务 。”第十七条规定：“综合管理类的非领导职务分为：巡视员、副巡视员、调研员、副调研员、主任科员、副主任科员、科员、办事员 。”
2018年12月29日，第十三届全国人民代表大会常务委员会第七次会议审议通过了《中华人民共和国公务员法（修订草案）》，综合管理类公务员职级层次分为四等十二级：
一级巡视员、二级巡视员、一级调研员、二级调研员、三级调研员、四级调研员、一级主任科员、二级主任科员、三级主任科员、四级主任科员、一级科员、二级科员 。
“副主任科员”这一职务将成为历史 。
参考资料来源：百度百科-副主任科员
副科级干部与副主任科员有什么区别副科级是“领导职务”，是所在单位（部门）的领导成员；副主任科员是“非领导职务”，虽然相当于副科级，但它不是单位（部门）的领导成员 。举个例子：一个地级市的某某局，比如教育局，它是处级单位，局长是正处级，局里面的科，比如人事科，科长就是正科级，副科长就是副科级，科里面的普通工作人员，一般就是科员，根据资历或表现，科员可以晋升为副主任科员，它在某些方面可以相当于副科级，但并不是副科长；同理，副主任科员可以晋升为主任科员，“相当于”正科级，但也并不是正科长 。科长、副科长是这个科室的“领导”，而主任科员、副主任科员并不是领导 。还有，现在机关公务员改革有一个名词叫作“改非”，就是领导干部到达一定年龄后（还没退休），离开领导岗位，担任“非领导职务”，比如原来的科长（正科级），不再担任科长，保留级别，就变成“主任科员”了 。
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