r语言go富集 r语言go富集分析三个( 三 )


2 cytoscape 的插件cluego可以傻瓜式实现通路的图片展示,可以用来直接发文章(低分的至少可以)
3 关于GO和KEGG数据的获得,上DAVID就好
R语言可视化之ggplot2——KEGG通路富集分析之前分享了如何用ggplot2可视化GO分析r语言go富集的结果 。既然做了GO,当然少不了KEGG了 。
同样的,r语言go富集我们从 DAVID 获取KEGG pathway的结果 。
对于KEGG,我比较喜欢做气泡图,这样用两种形式的图结合在一起,效果更丰富更好看一点 。
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