鸟哥私房菜的解释是：shell script是利用 shell 的功能所写的一个"程序" ， 这个程序是使用纯文本文件，将一些shell的语法与命令(含外部命令)写在里面，搭配正则表达式、管道命令与数据流重定向等功能，以达到我们所想要的处理的目的 。不明觉厉，好像更看不懂了···
Jude 的简单粗暴大白话解释是：脚本就是Linux中很多命令按照一定规则的组合，以实现某个特定的功能 。Linux中有很多简单的命令，往往只是进行了简单的对话 ， 比如 cd 就是进入到某个目录，简单直接 。但是如果我想进入某个目录A ， 然后在目录A中创建目录B，再在目录B中创建文本C呢？当然可以一步一步操作，如果想要一步到位呢 ， 那就可以用脚本，把三个命令写在一起，一起执行 。好像有点啰嗦···
或者从英语的角度去理解，脚本的对应英文是Script，而这个单词的中文释义中还有剧本的意思 。剧本就好理解了啊，剧本就是导演(生信工程师)基于某个主旨(要实现的目标)按照一定的手法(规则)所写的一个故事 。不管是哪个演员，都得按照剧本演 。所以，学好英语对于生信也是有帮助的~
按照脚本的复杂程度可以分为：
这个无需多说，其实就是若干个简单命令的顺序排列，执行脚本后会按照命令的前后关系从前往后一一执行 。
相对于简单的基本脚本，结构化的命令脚本可以施加逻辑流程控制，从而改变程序(命令)执行的顺序 。基本脚本中的命令就是从上往下执行 ， 但是结构化的命令脚本可以根据逻辑判断重复或者跳过某些命令 。
常用的结构化命令(语句)有：
后面还有什么嵌套循环啊啥的，不过我觉得上面的7中命令学到家了，应该可以应付大部分在生信分析里面的应用了 。
记得高中的时候 ， 物理老师(也是班主任)在给我们讲解习题时有个有意思的套路：不管什么难题现在下面写个"答："，以示自己解决问题的决心，也是一种正向的心理暗示 。脚本编写也是有套路的 ， 不过总的来说还是比较简单 。
对于简单的脚本(超级简单的那种)，直接几个命令连在一起即可，中间用"；"隔开 。
对于更长更复杂的脚本 ， 一般需要创建一个文本，并在里面编辑 。这就涉及到了文本编辑器 ， 比较常用和简单的一般有nano和vim，实在很简单，规则也容易理解，教程随手可得，不多说 。
比如用vim创建了一个脚本之后，具体的语法(套路)：
ok，脚本写完了，怎么让脚本开始工作呢？这有涉及到之前讲过的环境变量和相对路径、绝对路径了 。方法有三：
就这么多吧 ， 应该有点感觉到了，剩下的就是狂练狂练了~
关于linux脚本和基本命令和linux脚本是什么语言的介绍到此就结束了，不知道你从中找到你需要的信息了吗 ？如果你还想了解更多这方面的信息 ， 记得收藏关注本站 。
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