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linux调用线程的命令 linux线程相关函数( 二 )

IT技术命令


__pthread_manager()就是管理线程的主循环所在，在进行一系列初始化工作后，进入while(1)循环 。在循环中，线程以2秒为 timeout查询（__poll()）管理管道的读端 。在处理请求前 ， 检查其父线程（也就是创建manager的主线程）是否已退出 ， 如果已退出就退出 整个进程 。如果有退出的子线程需要清理，则调用pthread_reap_children()清理 。
然后才是读取管道中的请求 ， 根据请求类型执行相应操作（switch-case） 。具体的请求处理 ， 源码中比较清楚 ， 这里就不赘述了 。
3.线程栈
在LinuxThreads中 ， 管理线程的栈和用户线程的栈是分离的，管理线程在进程堆中通过malloc()分配一个THREAD_MANAGER_STACK_SIZE字节的区域作为自己的运行栈 。
用户线程的栈分配办法随着体系结构的不同而不同，主要根据两个宏定义来区分，一个是NEED_SEPARATE_REGISTER_STACK，这个属 性仅在IA64平台上使用；另一个是FLOATING_STACK宏，在i386等少数平台上使用，此时用户线程栈由系统决定具体位置并提供保护 。与此同 时 ， 用户还可以通过线程属性结构来指定使用用户自定义的栈 。因篇幅所限，这里只能分析i386平台所使用的两种栈组织方式：FLOATING_STACK 方式和用户自定义方式 。
在FLOATING_STACK方式下，LinuxThreads利用mmap()从内核空间中分配8MB空间（i386系统缺省的最大栈空间大?。?果有运行限制（rlimit），则按照运行限制设置），使用mprotect()设置其中第一页为非访问区 。该8M空间的功能分配如下图：
图4 栈结构示意
低地址被保护的页面用来监测栈溢出 。
对于用户指定的栈，在按照指针对界后，设置线程栈顶 ， 并计算出栈底 ， 不做保护，正确性由用户自己保证 。
不论哪种组织方式 ， 线程描述结构总是位于栈顶紧邻堆栈的位置 。
4.线程id和进程id
每个LinuxThreads线程都同时具有线程id和进程id ， 其中进程id就是内核所维护的进程号，而线程id则由LinuxThreads分配和维护 。
在Linux系统中使用Shell实现多线程运行任务（多任务并发执行） 2022-05-30 最近，有一批任务需要把两批的fastq合并到一起并压缩成一个fastq文件才能继续往下做，由于存储空间有限又不能直接全部跑上，只能按样本逐个分批跑 。众所周知，一般fastq是成对存在的 ， 所需要对read1和read2分别合并一次，然而这次任务的fastq文件比较大，合并然后压缩一次需要1天左右，那对于一组fastq就要2-3天，这也太耗时间了，所以我在想能不能read1和read2 同时跑上，这就可以节省一半的时间了 。
平时也能遇到很多类似的任务，特别是在进程数有限的情况下，如果这些小任务单独占用一个进程 ， 而任务很多就很耗时间，如果能在一个进程下实现多个线程并行执行，就能大大提高运行效率 。关于进程和线程的知识可以参考知乎的这篇文章【 Shell“ 多线程”，提高工作效率 】，整理的也比较有条理，能比较容易读懂 。
当然，某些博主也写过类似的文章 ， 例如这篇【 shell后台限制多并发控制后台任务强度进行文件拷贝 】但是实在是太高深莫测了，看不懂 ， 一时半会儿也学不会 。本文将示例Shell实现多线程的简单版本，其实不用太复杂 。
其实只需要两个步骤， 第一步是给需要并行运行的命令行在结尾加上"" ， 代表放到后台运行，第二步是在在所有并行任务的后面加上一句“wait”，意思是等所有通过“”放到后台运行的任务跑完后再继续执行后面的任务  ， 这些就能实现所有带有“”的行并行执行了 。

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