dchip dna芯片分析软件教程

【dchip dna芯片分析软件教程】最成功的生物芯片是以基因序列为分析对象的“微阵列”,又称基因芯片(基因芯片)DNA芯片(DNA芯片) 。根据芯片上固化的生物材料的不同,生物芯片可分为基因芯片蛋白质芯片细胞芯片和组织/12334,Gene 芯片又称DNA 芯片(DNAchip)或DNAmicroarray 。

1、DNA/RNA序列比对 软件整理文章只记录我自己的学习和使用 。请指出任何错误,我会立即改正 。在比较工具时,通常分为DNA比较工具(DNAseq)和RNA比较工具(RNAseq) 。两者的区别在于是否会考虑跨外显子比对,即未配对的阅读是否会被拆分,被拆分的两部分是否会再次比对) 。随着各种seq测序的出现,我们不能简单的通过对比DNA或者RNA来判断 。

(PROseq/GROseq,虽然他们在构建数据库时捕获了RNA,但是他们的比对不需要考虑跨外显子 。通用工具:DNAseq:BWA;;bowtie

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