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nmds分析用什么软件

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有什么用？...scale 分析 method(非度量多维标度)，如果有多个响应变量，仍然没有解释变量，我们可以使用排序(间接梯度分析)到分析 data ， 例如，主成分分析(PCA)，对应关系分析(CA) ， 去趋势对应关系- 。

1、8.群落结构差异显著性非参数替代的多元方差分析(ANONIS)、相似度分析(ANOSIM)和多反应替代法(MRPP)常用于评价不同采样点之间微生物群落组成差异的显著性 。一般来说，当我们通过降维、聚类等 。分析 ， 我们可能观察到微生物群落在不同批次、不同处理组、不同采样点等情况下，会有不同的聚集和分类(差异) 。，但这些差异是否显著，只有经过上述统计检验后才能得出 。

MRPP(Multi-respons ibility Separation Procedure)分析是一种用于分析高维数据集之间相似性的统计方法，基于距离矩阵，用于判断数据集之间是否存在显著差异 。在生态统计学中，可以用MRPP 分析(常与排序分析)来看不同环境下群落组成结构的差异是否显著 。

2、我最近想做宏病毒组相关的课题,有人知道宏病毒组生信 分析主要 分析...1 。真核病毒和噬菌体分类2 。噬菌体宿主预测3 。病毒组成分析4.α，β多样性分析5 。PCA/PCoA/NMDS/clustering分析6 。组间差异/Lefse分析7 。核心病毒分析8 。病毒丰度/18 。
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3、统计 分析中的各种A在微生物分析中，有大量的A，如PCA、PCoA、RDA、CCA、ICA等等 。网上有很多文章介绍每一种，但是很少有文章把它们放在一起比较 ， 解释清楚 。此外，它们之间有一些显著的差异，甚至对知道的人来说是一些愚蠢的答案 ， 如MDS的解释成分 。那我就在这里重点跟大家介绍一下 。

大部分A都是围绕着一个点，这个点就是降维 。PCA可能是最常见的一种 。由于其原理简单，与降维前的数据相关性好，所以应用范围也非常广泛 。然而，由于其过于简单的假设，在许多实际应用中的降维效果是有限的 。原则上我们已经完成了PCA，这里不再赘述 。可以看看参考文章PCA的数学原理，基本上就是线性代数中各种矩阵的运算 。

4、使用Canoco5.0进行RDA 分析中问题求助

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