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如何在ncbi上分析假基因

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请问这个ncbi ， 怎么找保守序列？ncbi有一个conserveddomain的数据库，你可以和它比较一下，分析 lower domain 。如何分析 基因测序结果1 ， 假设你测一个基因 ， 如何检查基因引物的特异性，如果VIF大于10，说明有很强的相关性，这些基因引物高度相关 。

1、关于 基因的调取,具体的步骤这个检索是什么意思？在NCBI上搜索这个基因，然后会有FASTA序列，看看哪部分是CDS区，然后设计一对引物扩增完整的CDS区，然后会有限制性内切酶连接等各种常规套路 。首先，在网上获取基因序列并不是说在百度Google什么的上获取，而是要进入专业网站 。通常使用NCBI的GenBank 。当然 ， 也可以使用日本的DNADataBank和欧洲的EMBL，它们的数据是共享的 。

然后你需要找到这个序列信息中的编码区 。现在很多软件都提供ORF(开放阅读框)的搜索 。找到它最大的开放阅读框后，你开始设计引物 。上游引物从ORF的起始子开始，下游引物从终止子开始 。然后，你需要提取你的靶标基因可能表达的组织的总RNA，然后将总RNA逆转录成cDNA，再以cDNA为模板，用你设计的引物进行PCR扩增 。

2、 基因测序结果怎么看问题1:测序结果是什么分析测序结果分析测序是从5端进行的 。正向测序和反向测序是指分别对DNA的两条互补链进行测序，通常两个方向的测序结果经过校对后完全一致，才能认为是一个可靠的结果 。工作人员的测序结果一般提供两个文档，一个是文本的序列文档，另一个是Chromas软件打开的ABI文档 。1.找到引爆器 。ncbi. NLM . NIH . gov/blast . CGI，去掉引物序列 ， 找到目的片段 。

3、如何查 基因引物的特异性,就是看我们的引物是不是对这个 基因特异的,还...有专门的网站可以提供这种匹配 ， 也可以用BLAST什么的获取引物序列，在基因 group中进行匹配 。看你的引物是不是落在另一个基因，类似同源blast 。有两种判断方式:1 。NCBI工具的引物设计_PrimerBLASTNCBI和NCBI工具的引物设计和特异性检测工具_PrimerBLASTNCBI 2 。2.ucsc网站上的primerblast 。
【如何在ncbi上分析假基因】
4、对一种疾病相关 基因或其他感兴趣的 基因进行生物信息学 分析

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