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膜蛋白跨膜区段序列分析和预测

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如果去掉一部分基因跨膜如果去掉一部分基因蛋白如果去掉一部分基因跨膜如果得到蛋白如果去掉一部分基因的表达和分泌？它是一种重要的有机体 。-4/membrane-3跨膜regions的数量和位置是生物信息学的重要研究课题 ， 提出了一种预测membrane蛋白-1 ， -3/ 预测的精度与常用膜蛋白 预测软件TMpred相当 。

1、去掉 跨膜部分的基因是否就能得到表达分泌 蛋白的基因去除-0的一部分能否得到表达和分泌/蛋白的基因膜是蛋白的一种，具有重要的生物学功能 。-4.区域的数量和位置是生物信息学中的一个重要研究课题 。提出了一种新的连续小波变换最大谱方法 。该方法应用于八种SARSCoV膜 。-3/ 预测软件TMpred相当于MPtopo数据库中已知结构的131个新螺旋束蛋白(包含548跨膜area)-4 。

2、请生物高手帮我分析一下, 蛋白用TMHMM分析 跨膜区,可结果我看不懂你的结果很明显 。而且是最简单的结果 。无跨膜区，蛋白全膜外 。你自己可以理解 。曲线纵坐标是概率，横坐标是序列 ， 总共是2193AA 。红色表示跨膜面积，几乎都是以5%的概率在膜内 ， 里面的蓝色极低 。相反，紫色细线表示在膜外的概率，几乎是100% 。

3、根据信号假说,膜 蛋白(单次和多次 跨膜主要由停止传送信号及其编号决定 。新生肽是否含有停止转移的信号 ， 决定了新生肽是否穿过内质网膜，在内质网腔蛋白或膜蛋白中变得可溶 。N端信号序列和包含信号序列都可以作为初始转移信号，但是N端信号序列可以切除 ， 而包含信号序列不能切除 。膜蛋白 跨膜的次数是由所含信号序列和转移停止信号序列的数量决定的，这些信号是多肽链中疏水的氨基酸区域 。

根据多肽链中疏水氨基酸区域的数量和位置，可以预测 its膜透性 。另外，由于膜蛋白总是从胞质溶胶渗透到内质网膜中 ， 并且总是保持信号序列中正电荷较多的氨基酸面向胞质溶胶表面，所以同样的蛋白在内质网中的取向必然是相同的 。结果是蛋白在内质网膜中的取向是不对称的，决定了这个蛋白在与细胞器结合的其他膜的膜结构中的方向 。

4、... 预测 蛋白质等电点, 跨膜区域,信号肽,二级结构 预测?如果你有这两个基因，可以和DNAMAN对比，非常方便 。一般比较的同源性不是BLAST，而是DNAalignment 。可以使用MEGA软件 。用序列，做fasta不容易吗？构建一个txt文件，写出类似如下的东西: >你的genenameandotherstoffatttccctggg这是fasta格式 。
【膜蛋白跨膜区段序列分析和预测】
多上谷歌搜，记住是谷歌，不是百度 。搜索什么预测，应该有相应的软件或者网站 。科研不是靠“急用”就能得到的 。大部分不懂的东西还是要自己去找，没人知道的那么全面 。PCR的退火温度需要低于Tm，但是Tm会根据不同的条件而变化，所以我自己试了一下 。较高的退火温度会提高特异性，但不一定能出来 。一切取决于你的目的 。

5、如何解释 蛋白亚细胞定位在细胞核,但是 蛋白 跨膜 预测为膜外 蛋白如何解释蛋白亚细胞位于细胞核内 ， 但是蛋白跨膜预测都在细胞外蛋白 。或者你在NCBI数据库中发现了一个编码类似蛋白的基因 。如果有人做过这个基因的亚细胞定位实验，你也可以大致知道它编码的蛋白在细胞中的位置 。不同的物种和不同基因家族的成员可能是不同的 。最终还是需要实验来验证 。在功能基因的研究中，经常对基因编码的蛋白进行亚细胞定位，如蛋白与GFP、YFP、RFP等融合 。，并且观察到融合的蛋白或-的细胞内定位
6、如何 预测 跨膜 蛋白的信号肽是核苷酸 序列还是氨基酸 序列Yao预测蛋白的信号肽可以直接使用线上工具预测，使用比较广泛的工具就是singalIP 。你需要准备氨基酸序列然后放/，另外，丁香园里也有很多知识 。如果你不知道如何分析结果，你可以去花园问，氨基酸序列* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *。

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