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如何使用biojava设置a blast parser解析blast result BioJava设置一个BLAST解析器解析BLAST结果代码如下:import Java . io . *；import Java . util . *；import org . bio Java . bio . program . sax . *；import org . bio Java . bio . program . ss bind . *；import org . bio Java . bio . search . *；import org . bio Java . bio . seq . db . *；import org . XML . sax . *；import org . bio Java . bio . *；Publiclclassblastparser {//args除了vectors: China to the United States等冗余序列之外，都使用NCBIvecscreen函数 。NCBI . NLM . NIH . gov/vec screen/vec screen . htmlblast解析:Chinablast.ncbi.nl 。
1、怎样用NCBI/ blast做蛋白质同源性 分析详细点选择需要比较的蛋白质序列，在BLAST界面的EnterQuerySequence下面的大框中输入 。如果与数据库中的所有蛋白质序列进行比较，请在下面的选择搜索集中选择您需要比较的数据库 。程序选择中的比较可以根据个人需要进行选择 。如果进行两两比较或者多个序列，在EnterQuerySequence框中选择Aligntwoormoresequences，在弹出框中输入需要比较的序列，最后点击BLAST 。
2、测序结果怎么 分析测序结果分析测序从5个末端进行 。正向测序和反向测序是指分别对DNA的两条互补链进行测序，通常两个方向的结果经过校对后完全一致，才能认为是一个可靠的结果 。工作人员的测序结果一般提供两个文档，一个是文本的序列文档，另一个是Chromas软件打开的ABI文档 。1.搜索引物比对，去除引物序列，找到目标片段 。在DNAMan上比对，看引物能不能匹配(一个恒定 ， 一个反向互补) 。如果不是，可能不是你想要的序列 。如果能匹配，就以上游的第一条引物为分界线，去掉前一条 。有最后一个作为分界线 ， 剩下的就是去掉后者后的目标序列 。
3、如何利用biojava设置一个 blast解析器解析 blast结果【本地blast结果分析,本地BLAST】BioJava设置一个BLAST解析器解析BLAST结果代码如下:import Java . io . *；import Java . util . *；import org . bio Java . bio . program . sax . *；import org . bio Java . bio . program . ss bind . *；import org . bio Java . bio . search . *；import org . bio Java . bio . seq . db . *；import org . XML . sax . *；import org . bio Java . bio . *；Publiclclassblastparser {//args做的 ， er O(∩_∩)O哈哈~我有点开心(* ▽ *)康达装的blast，但是不知道为什么 。我在家里重装了一下blast工作正常，数据库建设部分:我遇到过一些关于grep，sed ， awk，for loop的问题 。我们再开一个记录吧，还有就是fa的格式 。

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