atacseq:(Assay for transposase accessibility,information throughput sequencing)是一种用于研究染色质可及性(通常理解为染色质的开放性)的方法 。原理是转座酶Tn5容易与开放染色质结合 , 然后对Tn5酶捕获的DNA序列进行测序 。
1、CHIP-seq的研究内容【chipseq 数据分析工具】Standard Advanced数据分析内容包括:(1)1)chip seq序列与参考序列的比较;(2)峰值采集:统计样本峰值信息(峰值检测和计数、平均峰值长度和中值峰值长度);(3)统计样本在基因和基因间区域的分布和覆盖深度;(4)给出每个样品的峰相关基因列表和GO功能注释;(5)分析多个样本中与峰值相关的基因的差异 。
2、ChIP-seq和CUT
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