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到目前为止 ， 基因相关的治疗策略主要有两类，即靶向治疗和免疫治疗 。TME通常被定义为肿瘤周围的环境，包括细胞外基质、血管、免疫细胞和神经元 ， 这些都与肿瘤的进展和治疗结果密切相关 。越来越多的研究通过实验阐明了TME浸润在各种癌症类型的免疫治疗反应和耐药性中的贡献，并讨论了其对患者预后的影响 。
2、学习生物信息学有哪些比较好的 网站或论坛?对比论坛建设的初衷，大家都有所了解 。如果有人有任何问题，你可以阅读我的博客，创造字母的技能树论坛诞生了！关于论坛建立的博客 。论坛建设的参与者是一群热爱学习，愿意整理分享学习笔记 ， 扩大交际圈的朋友 。在这里，我会给你一个详细的入门指导，告诉你如何参与论坛的建设，以便更方便地建立一个基于字母的技能树 。论坛结构论坛的结构已经初步成型，暂时不会有大的变动 ， 包括需要大家积极参与的四个板块 ， 分别是学员信基础、在线申请、组织学百科、研究热点，以及发帖前需要培训的三个板块，还有问答板块和病休板块，暂时隐藏 。你暂时不需要考虑版块本身会继续进化 。如果你有更好的建议，欢迎随时和我交流 。
3、TCGA甲基化芯片数据质控和过滤在第一步中 ， 我们获得了TCGA 32例OSCC患者的TN匹配样本和相应的临床信息，并形成了一个ChAMP对象，命名为my_Load 。在后续的差异分析之前，需要对信号值矩阵进行归一化处理 。这一步消耗了大量的计算资源，如果配置不当，可能会运行很长时间或者被中断 。删除缺失值样本后，还剩58个(29对)样本 。看到图中三个异常样本，删除它们和它们的配对样本 。
4、如何快速掌握TCGA数据库?按比例搜索你感兴趣的肿瘤，然后就会有很多研究 。每次学习结束后，都会有一个总结 。点进去会有临床数据，有的是变异和拷贝数变化的数据 。目前个人感觉这里临床数据比较方便，其他数据比如基因表达，比如cancerbrowser可能还是比较好的，各种数据都可以尝试 。但是TCGA原始数据还是认为一般都是专家处理，新手要多学习，站在巨人的肩膀上再去 。
5、请教关于TCGA数据的问题三周琦瑜，大战马超周瑜乘势前往南郡 ， 与曹仁交战，被曹操的计策打成重伤 。诸葛亮趁利，取了南郡 。不久之后，他们相继攻占了荆襄诸县 。刘备终于有了自己的土地 。周瑜还设下美人计，引诱刘备过河，娶孙权的妹妹孙尚香为妻，作为扣留刘备的诱饵 。赵云受诸葛亮秘技的影响，一次次粉碎周瑜的阴谋 。次年，刘备逃往荆州，周瑜追杀 。诸葛亮的计策让他嘲笑荆州兵，箭又射中了 。回到柴桑后，决定假取荆州，又被诸葛亮识破 。
6、如何处理TCGA的数据首先说一下背景 。在我结束之前，有很多生存曲线分析涉及其中 。针对我们在白血病中发现的一个差异基因，使用了TCGA的临床数据 。所需数据:TCGA的临床数据 。下来的时候会发现很多 。这个时候你需要做的就是筛选你需要的 。你需要的是:目标基因的表达，病人的存活时间，病人的生存/死亡状态 。这里的靶基因可以是你之前的差异基因分析/通路分析/临床分析获得的一个或几个基因 ， 你需要在接下来的生存分析中进一步验证其预后影响 。
但个人感觉SAS算法更准确，Gradprism在画图上更美观易操作 。取决于你的需求，检验算法:用KaplanMeier(KM)生存分析法计算生存时间和生存率，用Logrank检验比较生存差异，P值小于0.05，有统计学意义 。具体操作原理:根据目的基因的表达水平，将患者分为高表达组和低表达组，这里的分组方法可以基于平均值或中位数 。

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