结构域分析,MEME保守结构域分析

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1、酵母单杂交方法 分析转录激活活性的原理和过程0简介酵母杂交技术是分析DNA与细胞内蛋白质在体外相互作用的方法 。通过分析报道的酵母细胞中的基因表达 , 可以鉴定DNA结合位点,并可以发现潜在的结合蛋白基因 。或分析 。利用该技术可以筛选与DNA结合的蛋白质 , 不需要复杂的蛋白质分离纯化操作,直接从基因文库中获得编码该蛋白质的核苷酸序列,因此在蛋白质研究中具有一定的优势;而且酵母属于真核细胞 , 酵母系统得到的结果比其他体外技术得到的结果更能反映真核细胞中基因表达调控的真实情况 。1酵母单杂交技术的原理由LietalPfam数据库于1993年首次提出,它是一系列蛋白质家族的集合,每个蛋白质家族都以多序列比对和隐马尔可夫模型的形式表达 。Pfam数据库是一个庞大的蛋白质家族集合,依赖于多序列比对和隐马尔可夫模型(HMMs) 。蛋白质一般由一个或多个功能区组成,通常称为结构域 。结构结构域不同组合产生的蛋白质性质不同 。因此 , 蛋白质结构结构域的鉴定对于分析蛋白质的功能尤为重要 。
2、为什么要对蛋白进行跨膜 结构域预测?跨膜 结构域越多是不是越难分离跨膜蛋白有一个共同的特点 。其跨膜结构结构域一般为疏水性,胞外结构一般为亲水性 。是否可以用高特异性的蛋白酶处理 。通过疏水层析处理获得的多肽片段 。疏水层析:在高盐浓度下,蛋白质的疏水性增加,可以与疏水介质结合;然后盐度逐渐降低,不合理的肽由于疏水性不同依次洗脱 。完全是自己的想法,不知道能不能 。红柱表示跨膜区的可信度 。所谓正门槛,就看你怎么选择和使用了 。说白了,一般概率大于0.5,表示跨膜区的概率大于一半,但接近0.5表示什么都没说,概率是一半,所以预测结果是 。
3、《数据 结构域与算法 分析》C和C那个更好?【结构域分析,MEME保守结构域分析】什么版本有关系吗?我学的是数据管理,算法实现,方法 。我可以用C/C写我想写的东西 。嗯 , 买考试用的C语言版就够了(但不简单) 。c有更多更深入的内容 。我用的是数据结构和算法分析(c语言描述第二版),LarryNyhoff写的 。里面有三个骰子的那个,我觉得挺好的 。而且用C参与ACM比较好,因为它有可以直接调用的STL , 书上也讲了很多STL的实现 。
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