r语言怎么安装go.db R语言怎么安装ggplot

求助,R中GO.db程序包无法安装若手机安装软件时提示解析包错误,建议:1.此情况可能是下载的软件安装包不完整,建议您在网络稳定的情况下,重新下载安装 。2.查看手机内存是否充足 。3.检查其他软件是否可以正常安装 。4.可能是由于该软件版本和手机存在兼容性导致无法正常安装,建议查找该软件是否有其他版本,重新下载安装尝试 。楼主你好个人见解一般有几种情况:1,解析包下载的过程中出现了问题,导致解析包出错了 。可以尝试重新下载解析包试试,中途尽量保证不要出现暂停或者其他的过程;2,安装的过程中如果是手机或者SD卡空间不足的时候不知道会不会出现,反正本人没有遇到过,但是为了排除可能,可以看看空间尽量保证够;3,这个是在上面两条都不行,其实也是经常遇到的,就是版本的问题 。就是你的安卓系统的手机版本低了,而安装包需要的版本比较高 。比如,个人之前在装猎豹最新版的浏览器的时候就怎么也装不上,后来仔细看了一下版本说明发现猎豹需要最低的Android 4.0/iOS5.0及以上,而个人的是Android 2.3的版本 。希望和楼主讨论经验 。
R语言安装WGCNA , 碰到依赖包无法安装的情况加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法,可以用来鉴定高度 协同变化 的基因集, 并根据基因集的内连性和基因集与表型之间的关联鉴定候补生物标记基因或治疗靶点 。
相比于只关注差异表达的基因,WGCNA利用数千或近万个变化最大的基因或全部基因的信息识别感兴趣的基因集,并与表型进行显著性关联分析 。一是充分利用了信息,二是把数千个基因与表型的关联转换为数个基因集与表型的关联,免去了多重假设检验校正的问题 。
以上内容引用的网页:
感觉WGCNA挺合自己脾气的,想安装一下 。注定安装不会那么顺利 。
安装了WGCNA是在Rstuio上安装的 。用命令 install.packages("WGCNA")
执行完命令后,提示信息显示有三个依赖包(‘impute’, ‘preprocessCore’, ‘GO.db’)无法安装 。
然后再安装那三个依赖包 。
BiocManager::install("impute"),安装impute时,也会安装GO.db包 。遇到是否更新其他R包时,选择不更新 n.
library("WGCNA")
Error: package or namespace load failed for ‘WGCNA’ in loadNamespace(j - i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]):
不存在叫‘preprocessCore’这个名字的程辑包
然后再安装一下‘preprocessCore’包
BiocManager::install("preprocessCore")
做完以上工作,再执行一下library("WGCNA").
【r语言怎么安装go.db R语言怎么安装ggplot】 其中提示信息:载入需要的程辑包:dynamicTreeCut;载入需要的程辑包:fastcluster ;载入程辑包:‘fastcluster’意思是在使用WGCNA时,需要先载入这三个包 , 并且已经被直接载入了,不是错误信息 。
怎么安装r语言安装 data.table包1、通过选择菜单:程序包-安装程序包-在弹出的对话框中,选择你要安装的包,然后确定 。
2、使用命令
install.packages(package_name,dir)
package_name:是指定要安装的包名,请注意大小写 。
dir:包安装的路径 。默认情况下是安装在..\library 文件夹中的 。可以通过本参数来进行修改,来选择安装的文件夹 。
3、本地来安装
如果你已经下载的相应的包的压缩文件 , 则可以在本地来进行安装 。请注意在windows、unix、macOS操作系统下安装文件的后缀名是不一样的:
1)linux环境编译运行:tar.gz文件
2)windows 环境编译运行 :.zip文件
3)MacOSg环境编译运行:.tgz文件
注:包安装好后,并不可以直接使用,如果在使用包中相关的函数,必须每次使用前包加载到内存中 。通过library(package_name)来完成 。包安装后,如果要使用包的功能 。必须先把包加载到内存中(默认情况下,R启动后默认加载基本包),加载包命令:
Library(“包名”)
Require(“包名”) 1、查看包帮忙
library(help=package_name)
主要内容包括:例如:包名、作者、版本、更新时间、功能描述、开源协议、存储位置、主要的函数
R中: package 'GO.db' was built before R 2.10.0: please re-install it.如何解决这个应该是更新了R之后会出现吧 。推荐方法:在RStudio里更新一下所有R包 , 具体操作就运行一下下面这一行就行了:
update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE)
要是不想更新所有R包(可能比较费时),也可以单独下载你需要的那个包:
install.package("GO.db")
R 3.2.2怎么安装GO.db,能解决的都是是大神最好的办法重新安装
系统,如果不想安
那就下个360试试修复
系统文件
试试吧
如何安装R语言中的goseq包菜单中选程序包 里面有一个安装程序包r语言怎么安装go.db的选项,选镜像r语言怎么安装go.db的时候,选国内r语言怎么安装go.db的,然后找到quantstrat,点击进行自动下载安装r语言怎么安装go.db!
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