关于Linux的zcat命令的信息

Linux文本操作常用命令在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令:
通过多敲键盘,形成手感 肌肉记忆,熟练掌握这些命令,在以后生信分析中游刃有余 。以下是每个命令的详细的介绍(主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记)
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来:
参数的用法介绍:
注意事项:
用 cat 命令可以 查看文本 ,也可以 编辑文本 ,编辑文本要加符号 , 退出时,另起一行,按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件,tac逆向查看
结合管道符|使用
head / tail-n:查看文件的前 / 后 n 行,默认10行 (在R语言里head和tail默认是前6行) 。
less命令用得最多,more命令用得比较少
3.1less命令
less[参数]文件名
less命令重要的补充用法1 :
需要注意 退出 :只要使用less命令, 按q键
less命令重要的补充用法2 :
参数用法:
less命令 不加参数 查看文件:
less命令加 -N参数 查看文件:显示行号
less命令加 -S参数 查看文件:单行显示,非常规整
对比:less和cat命令显示文本行号的用法:less -N,cat -n
3.2more命令
**more **逐页查看,按空格翻页 , 按回车换行 ,more命令一般很少用,熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去,但是别的命令不一定会把换行符算进去 , 。
常见参数:
切记:用less命令,按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前:
排列后:
解释:1和0比,1大;7和0比,7大…在sort字典排序里,100816比1737?。?00816排在前面 。
命令行查看一个表格结构时,因为制表符对齐的原因,出现一个错位的现象 。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样,所以 加上-n参数,让数值有数学意义上的大小来排序。
uniq命令去重,只有两行出现重复,而且是相邻的两行,如果不相邻 , 即使出现两行一模一样,不会去重 。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之,uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1:
pastefile1 file2
-s:按行合并 演示
常见用法2:paste--
常见参数:
要养成一个好习惯,原始数据不要轻易修改,修改的东西另外保存,文本保存用 (重定向)或是(追加)
1.用less查看example.gtf,然后管道符传递给wc
2.截取example.gtf第9列的内容
3.在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4.在第3步的基础上排序、去重复并统计
5.在第4步的基础上,将空格替换成制表符
补充小知识 :
清屏 :controlL
查看历史(输入过的)命令 :history
linux中怎么查看压缩包中的内容linux下查看tar压缩包里面的内容 , 方法如下:
1、使用grep命令:
tar tvf Package_name.tar | grep Key_work
#例如:
[root@root ~]#tar tvf bb.tar
-rw-r--r-- root/root200 2011-10-20 17:27:00 aa
-rw------- root/root1303 2011-10-13 19:10:07 anaconda-ks.cfg
drwxr-xr-x root/root0 2011-10-13 19:38:54 Desktop/
-rw-r--r-- root/root37640 2011-10-13 19:09:59 install.log
-rw-r--r-- root/root4404 2011-10-13 19:08:45 install.log.syslog
[root@rhel55-37 ~]# tar tvf bb.tar |grep log
-rw-r--r-- root/root37640 2011-10-13 19:09:59 install.log
-rw-r--r-- root/root4404 2011-10-13 19:08:45 install.log.syslog
2、直接指定文件名或通配符
tar tvf Package_name.tar [filename;*keyword*]
[root@root ~]# tar tvf bb.tar install.log
-rw-r--r-- root/root37640 2011-10-13 19:09:59 install.log
[root@rhel55-37 ~]# tar tvf bb.tar *log*
-rw-r--r-- root/root37640 2011-10-13 19:09:59 install.log
-rw-r--r-- root/root4404 2011-10-13 19:08:45 install.log.syslog
Linux中cat和zcat命令的区别?cat是用于查看普通文件的 。zcat 是用于查看压缩的文件?单个磁盘的容量现在已经超过了 1TB,但是大型数据文件、日志文件、图像以及电影等媒体文件很快就把磁盘装满了 。为了节省空间,可以把许多文件压缩到原大小的几分之一 。例如 , Apache 日志文件(是简单的文本)可以压缩到原大小的十分之一 。?尽管压缩可以节省磁盘空间,但是也会增加工作量 。例如 , 如果需要分析压缩的 Apache 日志文件,就必须解压它,处理数据,然后重新压缩它 。如果有大量日志文件(如果保留分析趋势所需的记录 , 这种情况很常见),那么开销会非常大 。?幸运的是,gzip 套件包含许多可以 “在原地” 处理压缩文件的实用程序 。zcat、zgrep、zless、zdiff 等实用程序的作用分别与 cat、grep、less 和 diff 相同,但是它们操作压缩的文件 。想了解更多Linux命令,另外你是感兴趣的话可以看下刘遄老师写的《Linux就该这么学》作为入门的书籍 , 觉得不错的话采纳下哦~
linux怎样解压gz文件?单纯的.gz文件解压,这种文件不可以使用tar命令解压,需要用gunzip解压 , 使用命令gzip
解压:gzip -b pythontab.gz
但是注意:gzip貌似不能够设置解压到指定目录,只能解压到当前目录 。
解压单纯的.gz文件方法二:
使用zcat命令,然后把标准输出 保存到文件即可 。
例如:
zcatpythontab.gzpythontab.py
当然这个解决了解压到指定目录的需求 。
zcatpythontab.gz/home/test/aa/pythontab.py
以上就是linux下.tar.gz和.gz文件解压
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