用conda来安装大部分python/R/JAVA的软件包

2021-10-01

昨天发现了神器multiqc来整合分析一个目录下所有文件的quality control结果，今天来试着装了一下。
【用conda来安装大部分python/R/JAVA的软件包】然后又发现了conda这个使得生活更美好的package manger软件。官网上介绍conda是可以安装、更新和管理现在大部分流行的编程软件的包，比如python，R，java。
安装步骤：

先去官网下载一个.sh文件，然后bash 文件名.sh
根据终端里面的提示按yes往下
然后conda就安装好了

因为我一般都是要将软件装到服务器上，经常性会因为没有权限各种问题，但是conda的安装避免了这个问题，非常美好。
然后就是安装multiqc，直接跑下面的代码：

conda install -c bioconda multiqc

之后把该更新的包一更新，that's all done！
总结：
以后我会用conda来安装、更新、管理python和R的包，而且在这个过程中也不太用考虑服务器安装没有权限的问题，因为conda自动会安装到本地目录，而不是全局目录。

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