蛤蚧入药可生用，或制成各种成药，但活蛤蚧不便运输和贮藏，所以需加工成蛤蚧干 。
加工方法，将活蛤蚧置于地上 ， 用锤子对准其脑门轻击一下，使其昏死 ， 然后将蛤蚧的额部挂于加工台铁钉上，使其腹部朝上，左手握住蛤蚧，右手持尖头利刀，刀口向上 ， 刀尖自泄殖孔向前直切喉前部皮下，也可用剪刀从肛门剪至喉前部 。刀口或剪口线不直，加工出的蛤蚧切口边缘就不直，从而影响规格和质量 。除净内脏，勿伤内脏，不需清洗，用两根细竹条，竹条的长度约相当于四肢向左右伸展的长度，分别插入前肢和后肢，将四肢展开，用两根约lcm宽的薄竹片高叉固定四肢的基部，使其挺直 。用两根薄竹片 ， 长度相当于前后肢内侧的距离，两竹片并排在一起在宽度约等于竹长度，下面一片后角修圆，将腹壁左右横撑开，以绷足为度，用一根长于全身的扁竹条 ， 沿背部内面直伸到头腹皮下，再用棉纸条将尾和扁竹条捆成固定，以防尾折断 。然后放入烘炉内烘干 。检查蛤蚧于，如果成灰色 ， 眼睛全陷入，尾瘪，用手指击头部有响声表示已经足干，待凉取出 。将蛤蚧干按规格分大小等级 ， 两条对合，用棉纸条扎尾 ， 就成商品药材对蛤蚧 。本药材容易生虫，需用硫磺熏过，贮藏木箱内 。每隔一定时间需火焙一次，保持干爽，严防受潮 。
【蛤蚧采收加工方法 蛤蚧的加工炮制方法】1．炮制 。生的去头、鳞片和内脏 ， 直接入药或浸酒；干的切碎块浸酒；尾炙过研末入药 。
2．蛤蚧酒制法①生泡法：将活蛤蚧洗干净 ， 晾干水 ， 剖腹去内脏，抹去血，用50度以上的白酒浸泡，每5千克(10斤)酒放5-6条蛤蚧 ， 浸泡3个月 。若每5千克酒配放当归、肉苁蓉、龙骨、大枣、川芎、白芷等中药各40克（8钱），或加当归40克（8钱）共浸泡，都可增加酒味和功效 。少量浸泡，瓶装500克酒放蛤蚧l条，浸泡两个月 ， 喝完后还可加酒浸泡第2次 。②干泡法：将干蛤蚧用淡盐水洗去鳞和污物，切成小块浸泡，酒和蛤蚧比例和生泡法相同 。
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