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linux命令生信 linux 系统信息命令

IT技术命令

??我的生信入门day2 bio-linux简单操作仅供自己记录复习，并不严谨 。
主要是学习了bio-linux最基本的一些操作 。
1.linux命令组成 。命令?选项?参数 。
【linux命令生信 linux 系统信息命令】 2.创建共享文件 。windows和bio-linux的共享文件 。
3.访问路径：pwd
访问下一级：ll 空格 文件名
访问本级：ll
访问上一级：ll 空格 ..
进入下一级：cd 空格 文件名或目录名
进入上一级：cd 空格 ..
注意：访问只是弹出该目录下有的所有文件和目录 。进入是进入到下一级中的文件或者目录 。
4.显示文件lsls -als-l[文件长格式显示]
5.创建目录和文件 。mkdir 空格 目录名 ；touch 空格 文件名
6.复制cp、移动mv、删除rm文件 。不能操作目录 。操作目录：mv -r 、cp -r、rm -r空格 目录名，删除只能删除本操作目录下的文件 。
7.查看文件内容: cat 空格 文件名 。所以不能对目录cat ， 可以ll 注意：ll是访问，是文件的一些基本信息 。目录：cd 空格 目录名 。
8.修改文件：vi 空格 文件名 按下i显示insert就可以编辑修改了 。编辑修改完以后按下Esc后，打冒号： 然后wq保存，退出 。q!是退出不保存，按d删除内容 。
Linux 20题-生信技能树知识点:mkdir -p
touch filename#创建文件
知识点：touch的用法
知识点：vim or vi or sed 编辑文本
知识点：rm 命令
rm (-r) filename or file.txt#删除（彻底）文件或文件夹 ， 由于Linux系统没有垃圾桶，要慎用删除文件，可以rm -i filename删除前询问
知识点：mkdir -p folder{1..5}/../..
知识点： xargs的用法 xargs命令
知识点：for循环
for ...; do ...; done
知识点：rm -rf filename
知识点：grep用法grep命令和 wc用法wc命令
知识点：unzip的用法 unzip命令
知识点：cat 和less -S
知识点：tar用法和软件的安装
知识点：grep的递归搜索 grep 命令
知识点：awkawk用法 、cutcut用法 、sortsort用法 、uniquniq用法 、grep
知识点：cut、sort、uniq
知识点：unzip tree
知识点：cat /less /more ;awk/grep
知识点：cat/grep
知识点：cut /sort /grep/awk/uniq
知识点：cat/grep/awk/cut/sort/uniq
原题目链接：
生信技能树-jimmy的个人空间 - 哔哩哔哩 ( ゜- ゜)つロ 乾杯~ Bilibili
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Linux文本操作常用命令在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计linux命令生信的命令：
通过多敲键盘 ， 形成手感 肌肉记忆 ，熟练掌握这些命令，在以后生信分析中游刃有余 。以下是每个命令的详细的介绍（主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记）
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来：
参数的用法介绍：
注意事项：
用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 编辑文本 ，编辑文本要加符号，退出时，另起一行 ， 按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件，tac逆向查看
结合管道符|使用
head / tail-n:查看文件的前 / 后 n 行，默认10行 （在R语言里head和tail默认是前6行） 。
less命令用得最多 ，more命令用得比较少
3.1less命令
less[参数]文件名
less命令重要的补充用法1 ：
需要注意 退出 ：只要使用less命令，按q键
less命令重要的补充用法2 ：
参数用法：
less命令 不加参数 查看文件：
less命令加 -N参数 查看文件：显示行号
less命令加 -S参数 查看文件：单行显示，非常规整
对比：less和cat命令显示文本行号的用法：less -N，cat -n

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