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Linux常用命令三、文件相关
vi
vi file
按i键,进入编辑模式
按esc键,进入命令模式
:w 保存文件但不退出vi
:w file 将修改另外保存到file中,不退出vi
:w! 强制保存,不推出vi
:wq 保存文件并退出vi
:wq! 强制保存文件 , 并退出vi
q: 不保存文件,退出vi
:q! 不保存文件 , 强制退出vi
:e! 放弃所有修改,从上次保存文件开始再编辑
chmod
change mode , 变更文件或目录的读、写、运行权限
chmod [-cfvR] [--help] [--version] mode file...
mode:权限设定字串 , 格式如下 : [ugoa...][[+-=][rw xX ]...][,...]
u 表示该档案的拥有者,g 表示与该档案的拥有者属于同一个群体(group)者,o 表示其他以外的人,a 表示这三者皆是
+ 表示增加权限、- 表示取消权限、= 表示唯一设定权限 。
r 表示可读?。瑆 表示可写入,x 表示可执行,X 表示只有当该档案是个子目录或者该档案已经被设定过为可执行 。
chmod也可以用数字来表示权限 , 语法为:chmod abc file,如chmod 777 file
其中a,b,c各为一个数字,分别表示User、Group、及Other的权限 。r=4,w=2,x=1
chmod 777 file,等同于 chmod a=rwx file
chmod ug=rwx,o=x file , 等同于 chmod 771 file
chmod 4755 filename,可使此程序具有root的权限
ls -l 可以查看列出当前用户的文件权限
zip
zip -r filename.zip filesdir
zip -r test.zip ./_把当前所有文件压缩到test.zip
zip -r test.zip test,把test文件所有文件及目录,要是到test.zip
zip -d test.zip test.txt , 删除压缩文件中test.txt文件
zip -m test.zip ./test.txt,向压缩文件中test.zip中添加test.txt文件
zip -r test.zip file1 file2 file3 filesdir,处理多个文件和目录,空格隔开
unzip
unzip zip-file,解压到当前目录
unzip -d dst-dir zip-file,解压到指定的目录,-d后为指定目录
unzip -n zip-file,不覆盖已经存在的文件 , -n为不要覆盖原有的文件
unzip -n -d dst-dir zip-file,解压到指定的目录,不覆盖已经原有的文件
unzip -o -d dst-dir zip-file,-o不必先询问用户覆盖原有文件
unzip -l zip-file,仅查看压缩文件内所包含的文件
tar
tar cvf test.tar test , 把test下所有文件和目录做备份tar czvf test.tar.gz test , 把test下所有文件和目录做备份并进行压缩tar xzvf test.tar.gz,把这个备份文件还原并解压缩tar tvf test.tar | more , 查看备份文件的内容,并以分屏方式显示在显示器上
tar czvf test.tar.gz test --exclude=test/svn,备份压缩并排除目录
touch
Linux文本操作常用命令在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令:
通过多敲键盘 , 形成手感 肌肉记忆,熟练掌握这些命令,在以后生信分析中游刃有余 。以下是每个命令的详细的介绍(主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记)
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来:
参数的用法介绍:
注意事项:
用 cat 命令可以 查看文本 ,也可以 编辑文本 ,编辑文本要加符号,退出时,另起一行,按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件,tac逆向查看
结合管道符|使用
head / tail-n:查看文件的前 / 后 n 行,默认10行 (在R语言里head和tail默认是前6行) 。
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