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生物信息学 python，生物信息学应用学perl还是学python更好

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1，生物信息学应用学perl还是学python更好perl吧，仅仅应用到生物学的话学点简单的就好 ， perl就很简单python好，网上了解很多学生物信息的就是用python
2 ， PerlRPython在生物信息学中是怎样的角色应该说Python/Perl是相互替代的脚本语言，但个人推荐用Python, 虽然很多老的生物信息软件是用Perl,Python学习曲线好，功能也更强大，是发展趋势 。这两个语言主要是做数据预处理、文本处理和格式转换、对算法效率要求不高的分析软件开发，系统管理和pipeline搭建等工作 。R语言主要的优势是大量的统计包的支持，数据统计分析中非常常用 。Python和R有良好的接口 。关于绘图很多人用R,其实Python的Matplotlib的绘图效果比它漂亮很多，也更强大 。对pipeline的搭建shell编程更适合，是一个不可缺少的技能 。与数据库相关的工作需要用到SQL，Linux : 操作系统 ， 是基础 。生物信息对Linux的要求其实并不高 ， 并不是要做系统开发者或管理员 ， 只需要会用就行 。复制粘贴、处理数据、安装软件等 。生物信息软件：标准数据分析 。生物信息学的数据格式已经基本标准化 ， 大部分工作可以直接用软件完成 。Perl和Python：处理个性化问题、软件之间的对接 。这两门语言至少应该熟练掌握一门自己写程序用，另外一门要能看得懂 。写点小脚本感觉差别不大，但是perl写大程序不合适 。很多人认为python是趋势，但至少截止目前更多生信软件是用perl写的 。所以，如果刚开始学，建议主打python, 看懂perl 。R ：数据处理、统计、绘图、数据分析 。R语言的数据结构跟其他语言差异较大、而且总感觉语法比较散，不好记 。但是R的软件包却异常强大 。数据处理的reshape2, dplyr；绘图的ggplot2；还有Bioconductor里的几千个包 。不得不会 。
3，处理生物信息学上的问题用perl好呢还是Python好呢纠结要学哪个显然是perl 啊 ， bioperl 让你得心应手 。你好！python好，网上了解很多学生物信息的就是用python仅代表个人观点，不喜勿喷，谢谢 。主要是他的简单，强大我也正好要看这方面，决定用python【生物信息学 python，生物信息学应用学perl还是学python更好】
4，常用的生物信息学python库有哪些常用的生物信息学python库：TkinterPython默认的图形界面接口 。Tkinter是一个和Tk接口的Python模块，Tkinter库提供了对Tk API的接口，它属于Tcl/Tk的GUI工具组 。PyGTK用于python GUI程序开发的GTK+库 。GTK就是用来实现GIMP和Gnome的库 。PyQt用于python的Qt开发库 。QT就是实现了KDE环境的那个库，由一系列的模块组成，有qt, qtcanvas, qtgl, qtnetwork, qtsql, qttable, qtui and qtxml，包含有300个类和超过5750个的函数和方法 。PyQt还支持一个叫qtext的模块 ， 它包含一个QScintilla库 。该库是Scintillar编辑器类的Qt接口 。wxPythonGUI编程框架，熟悉MFC的人会非常喜欢，简直是同一架构（对于初学者或者对设计要求不高的用户来说，使用Boa Constructor可以方便迅速的进行wxPython的开发）PILpython提供强大的图形处理的能力，并提供广泛的图形文件格式支持，该库能进行图形格式的转换、打印和显示 。还能进行一些图形效果的处理，如图形的放大、缩小和旋转等 。是Python用户进行图象处理的强有力工具 。Psyco一个Python代码加速度器 ， 可使Python代码的执行速度提高到与编译语言一样的水平 。xmpppyJabber服务器采用开发的XMPP协议，Google Talk也是采用XMPP协议的IM系统 。在Python中有一个xmpppy模块支持该协议 。也就是说 ， 我们可以通过该模块与Jabber服务器通信，是不是很Cool 。PyMedia用于多媒体操作的python模块 。它提供了丰富而简单的接口用于多媒体处理(wav, mp3, ogg, avi, divx, dvd, cdda etc) 。可在Windows和Linux平台下使用 。PmwPython megawidgets，Python超级GUI组件集，一个在python中利用Tkinter模块构建的高级GUI组件，每个Pmw都合并了一个或多个Tkinter组件，以实现更有用和更复杂的功能 。PyXML用Python解析和处理XML文档的工具包，包中的4DOM是完全相容于W3C DOM规范的 。它包含以下内容：xmlproc: 一个符合规范的XML解析器 。Expat: 一个快速的，非验证的XML解析器 。还有其他和他同级别的还有 PyHtml PySGML 。PyGame用于多媒体开发和游戏软件开发的模块 。PyOpenGL模块封装了“OpenGL应用程序编程接口”，通过该模块python程序员可在程序中集成2D和3D的图形 。NumPy、NumArray、SAGENumArray是Python的一个扩展库，主要用于处理任意维数的固定类型数组，简单说就是一个矩阵库 。它的底层代码使用C来编写，所以速度的优势很明显 。SAGE是基于NumPy和其他几个工具所整合成的数学软件包 ， 目标是取代Magma, Maple, Mathematica和Matlab 这类工具 。MySQLdb用于连接MySQL数据库 。还有用于zope的ZMySQLDA模块，通过它就可在zope中连接mysql数据库 。Sqlite3用于连接sqlite数据库 。Python-ldap提供一组面向对象的API，可方便地在python中访问ldap目录服务 ， 它基于OpenLDAP2.x 。smtplib发送电子邮件 。ftplib定义了FTP类和一些方法，用以进行客户端的ftp编程 。如果想了解ftp协议的详细内容，请参考RFC959 。PyOpenCLOpenCL的Python接口，通过该模块可以使用GPU实现并行计算 。5，想入生物信息学这个行业python学习要达到什么程度生物信息学编程，任何计算机语言都可以，语言是工具，人脑思想才是核心 。不过 ， python语言有点小众，我还是建议你用c语言或者c++，这样编写的程序可以方便移植到linux里面，1、首先要解决的问题是自己能写代码解决问题 。也就是说通过学习Python学会编程 。2、 再将编程用在生物计算上面 。6 ， 生物信息学编程选Python语言可行吗生物信息学编程，任何计算机语言都可以，语言是工具，人脑思想才是核心 。不过，Python语言有点小众，我还是建议你用c语言或者c++，这样编写的程序可以方便移植到Linux里面 ， 建议学习python，python 具有简单易学、代码规范、语法简单、可移植性强、支持多平台、类库丰富等优点 。另外 ， python的社区支持要非常好，网络资源更加丰富 。生物信息学一般需要处理大量的文本、数据 ， python提供便捷的数据结构来处理文件、字符串等，提高你的编程效率 。good luck!

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