当SRA 文件转换为fastq.gz文件using NCBI数据分析时，第二个问题是如何将SRA 文件转换为常用的fastq- 。怎样才能把这个文件分成两个或多个文件？matereads和paired end reads有什么区别？从SRA 文件中分离成对的endreads很多时候，成对的EndReads是从NCBI SRA文档中分离出来的 。
1、matereads和paired-endreads有什么区别从SRA中分离成对序列文件多次，成对序列数据从NCBI的SRA文档中分离出来 。但是我们在使用SRAtoolkit的fastqdump工具时，往往只能得到一个文件而不是两个文件 。怎样才能把这个文件分成两个或多个文件？答案是不一定 。首先，我们可以尝试使用fastqdump的–split 3参数 。
2、如何从SRA 文件中分离出从对短序paired-endreads如何从SRA中分离配对序列文件我们多次从NCBI SRA文件中分离配对序列数据 。但是我们在使用SRAtoolkit的fastqdump工具时，往往只能得到一个文件而不是两个文件 。
3、多线程将SRA 文件转化为fastq.gz 文件【sra文件的分析,SRA文件】在使用分析的NCBI数据时，第二个问题是如何将SRA 文件转换成常用的fastq 文件 。由NCBI官方提供的SRAtoolkit包含了FastDump，一个非常简单的命令，直接转换成压缩的fastq.gz文件.However,这个命令是单线程的 ， 遇到大量SRA数据的时候非常慢，所以后来开发了一个FastDump，可以多线程转换 。
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