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2、...测序对处于恢复期的COVID-19患者进行免疫 细胞 分析影响因子:6.255PMID:期刊年卷:CellDiscov20206生物区2 细胞生物Q260/190 doi:10.1038/s 1689利用单细胞测序 , 作者分析分析了血液中免疫群体的复杂性,以及 。作者鉴定了ERS患者的高炎症反应,可以解释部分患者出院后发病的原因,建议重新评估现行的出院标准 。

3、完整的单 细胞 分析通用流程——从数据到可视化本章概述了scRNAseq 分析(图1)的典型工作流框架 。稍后将更详细地描述每个步骤 。在开始分析本身之前,讨论一下实验设计可能会有帮助 。最明显的问题就是技术的选择,大致可以分为:1 。基于液滴的:10XGenomics , inDrop,Dropseq2 。基于平板的唯一分子标识符(UMI):cel seq,MARSseq3 。板块式阅读:Smartseq24 。其他:sciRNAseq,SeqWell,这些方法各有利弊,在其他地方被广泛使用 。Ziegenhain等人2017()) 。

基于纸板的方法可以捕获其他表型信息(如形态学) , 并且更适合于定制 。基于Reads的方法提供了完整的转录覆盖,这在一些应用中非常有用(如剪接和外显子突变) 。基于UMI的方法将减少PCR扩增噪声的影响 , 因此更受欢迎 。方法的选择视具体情况而定,但我们下面的分析 process大部分方面都与技术无关 。

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