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进化树怎么分析,基因家族进化树怎么分析

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如何分析本系统进化树形图？如何构造进化tree分析sequence？如何构建系统进化 tree和分析？如何从进化的角度使用mega 分析 进化树到分析 。如何分析系统发育树是否支持进化关于物种的起源和分化从分叉处就可以看出来，有许多方法可以构建进化树 ， 您可以下载该软件或在线构建，应该不可能分析 。
/MAGA-1/swingman8(站内联系TA)NCBI，用blast找相似序列只能说是相似性比较，用软件组件进化tree to分析同源性应该是这样的 。我现在的问题是我会画树，但是我不会- 。使用Clusterware或clusterW进行多次比较，获得的数据可以与MAGA一起用作树 。
1、如何进行系统 进化树的构建和 分析?我这有测好的基因序列,但是不知道该...我给大家介绍一个软件，DNAman，它可以利用多序列比对功能构建一个系统进化 tree 。首先你需要一个可以编辑序列的软件(比如Mac系统的MacGDE，WIndows的BioEdit，Mega ， Genuis ， ClusterX等 。)对整个数据库进行排序，也就是把相似的站点放在一起 。
2、如何用mega 分析 进化树,,高分求啊 。。。不应该分析 。这棵树有什么好分析？只是让别人看看，看看是不是最接近那个模式菌株 。事实上，如果真正的同源性是分析 ， 也就是你在数据库里比对 ， 同源性最高的菌株有分析值 。其他菌株只是一个比较 。这张图中同源性最高的菌株是100，和那个菌株是一个物种 。最后提醒一下:如果是模式菌株，后面要加个上标“T” 。
3、如何 分析系统发育树是否支持 进化论从分叉处可以看出物种的起源和分化 。构建系统进化树应注意的几个问题:1 .相似性和同源性的区别:只有当序列与一个祖先进化发生分歧时，才是同源的 。2序列和片段可能彼此相似，但某些相似性不是由于进化的关系或相似的生物学功能 。也许最明显的例子是特定的序列组成或片段重复 。然后是非特异性序列相似性 。进化树法:物种间的相似性和差异性可以用来推断进化的亲缘关系 。
五个分支的长度可以用来表示类之间的真实进化距离 。理解系统开发中计算能力的局限性很重要分析 。任何树构造实验的目的，基本上都是从众多不正确的树中选出正确的树 。没有任何方法可以保证一个进化树一定代表真实的进化通路 。但是，有些方法可以检验进化树检测的可靠性 。第一，如果不同的方法能得到相同的结果，就能很好地证明树是可信的；第二，可以对数据进行重新采样 ， 以测试它们的统计显著性 。
4、怎么 分析这个系统 进化树图?有图 。求大侠赐教? A节点是来自序列的进化关系的新种 。因此可以看出，19在已鉴定的菌株中没有出现过，是一个新种 。从进化 分析的角度 。1，3 ， 4，5，6 ， 7，8 ， 9属于一个集群，进化的关系比较近 。靠近底部的物种群 。根据以上结果，可以进一步做生理生化鉴定，确认物种 。
5、细菌16SrDNA序列 分析以后,怎么构建 进化树下载软件或在线构建软件的方法有很多 。网上构建可以把你的序列输入到PUBMED的Blastn里进行比对，结果有一个是进化树，但是里面的序列太多了，所以要逆序选择 。软件有很多，简单的有DNAstar中的Megalin ， 但是结果比较粗糙 。建议用ClustalX软件进行同源性比较，然后用MEGA3.0软件进行系统发育分析并绘制系统发育树，也很简单，看说明书就可以了 。
6、构建 进化树前怎么 分析序列?掐头去尾首先你需要一个可以编辑序列的软件(比如Mac系统的MacGDE，WIndows的BioEdit，Mega ， Genuis，ClusterX等 。)对整个数据库进行排序，也就是把相似的站点放在一起 。同时 ， 您应该决定用于构建树的方法，一般使用MaximumLikelihood(Paup) ， Bayesian(MrBayes) 。
7、MEGA做出来的 进化树要怎么 分析【进化树怎么分析,基因家族进化树怎么分析】这个问题还是很容易的MEGA41 。打开MEGA4软件2，选择对齐>对齐浏览器/Clustal 3 。选择createanewalignment4 ， 蛋白质点击否分析输入序列什么都不要说 。5.在菜单栏对齐中使用AlignbyClastalW6，6.用默认参数比较多个序列 。7.单击数据菜单栏中的ExitAlnExplorer8，8.单击“是”保存currentalignsession( 。mas)和Mega)，9.我认为你将暂时建立系统发育学 。可以使用NJ(neighborhood joining)和MP(Maximumparsimony)方法，当然还有很多其他的方法 。根据不同的标准，选择需求，10.调整参数并计算 。

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