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mega 6进化树分析,如何用mega构建进化树

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megaSoftware分析megaFile一直显示错误？答:megaSoftware分析megaFile总是显示错误 。mega 进化部分树枝不是mega 进化部分树枝不是Mega 进化树枝一般参考神奇宝贝，比如进化从小龙到大龙的过程可以分为几个阶段:小火龙、火恐龙、火山龙、大龙 ， 大龙是Mega 进化 tree的分支 。

1、使用Linux版的MEGA构建某一基因家族的基因 进化树最近遇到一个需要构造某个基因家族的进化 tree，并根据进化关系进行分类 。这让我想起之前上课的一位老师做的进化，他告诉我们 ， 如果不是纯粹为了进化的题目，MEGA就够了 。因为windows的内存有限，做几十个基因可以，做几百个基因就吃不消了，所以想到了用Linux下的MEGA来做 。因为它是二进制文件，所以可以通过直接提取它并将其添加到环境变量中来使用它 。

最后一步，我得到了这个基因家族所有基因家族的蛋白质序列，然后和windows下MEGA的muscle算法进行了对比 。最后对比后得到了multiproteins.fasta文件 。首先对参数进行解读 。与其他软件相比，我认为这个软件更容易理解和使用 。

2、如何进行系统 进化树的构建和 分析?我这有测好的基因序列,但是不知道该...我给大家介绍一个软件，DNAman，它可以利用多序列比对功能构建一个系统进化 tree 。首先你需要一个可以编辑序列的软件(比如Mac系统的MacGDE ， WIndows的BioEdit，Mega，Genuis，ClusterX等 。)对整个数据库进行排序，也就是把相似的站点放在一起 。

3、如何读懂 进化树MEGA比较也可以 。MEGA的功能很多，但她的特长是做出成绩 。ClustalX功能很多，也能做出成绩，但它的特长是比较 。如果说MEGA和ClustalX有区别的话，那一定是算法上有区别 ， 因为两个软件的程序不是同一个人写的 。至于区别，我没见过原码也不知道 。就像两个音乐人，一个擅长吉他 ， 一个擅长架子鼓 。

4、用 mega做 进化树事错误提示:Nocommonnucleotidesites应该是序列差异太大 ， 根本没有同源性 。去掉差异太大的序列，重新做一棵树 。我以前也遇到过这种情况 。随便试几个 ， 就要比对有同源性的序列 。如果你的序列中有间隔，那么你是否设置了间隔符号(即问号、空格等 。)?如果序列中有间隔，请使用这些符号 。找出缺口并用这些符号替换的目的是为了保证不同序列长度的一致性 。

当你选择PairwiseDeletion时，根据它的原理，无论是有一个碱基缺失的序列还是没有碱基缺失的序列，在计算时都会被分成两组，也就是你在分析中的模型参数会根据不同的数据集进行估计，所以很容易出现不计数的问题 。因为我不知道你的数据集是怎么处理的，所以请检查一下我上面说的 。首先设置间隙符号，最后校对间隙 ， 使序列具有相同的长度 。毕竟我们的序列经常出现在测序中，而且数量一般都不多 。

5、 mega建树上面的百分比怎么添加 mega是一个关于序列分析和比较统计的工具包，包括距离建树法和MP建树法；可以自动或手动进行序列比对，推断进化 tree，估算分子进化 rate ， 进行进化假设检验，搜索在线Web数据库 。下载后可以直接使用 ， 主要包括几个功能软件:i) 分析软件用于i)DNA和蛋白质序列数据 。Ii)在将序列数据转换成距离数据之后，用于距离数据的软件 。

Iv)当独立处理序列的每个碱基/氨基酸(碱基/氨基酸仅处于0和1的状态)时 ， 对序列执行分析的软件 。打开进化 tree，点击顶行的View，选择option ， 选择Branch，会看到以下选项 。选中Hidevalueslowerthan，然后将百分比调整为50，并单击确定 。

由于服务器问题,6、 mega软件 分析 mega文件老显示错误 mega文件不可用 。Mega在启动后的最初几天经历了新用户的涌入，服务器目前可能无法很好地处理这种负载 。上传文件可能会导致问题 。您可以通过右键单击上传队列中的文件并选择取消传输来取消传输 。megaSoftware分析megaFile一直显示错误？答:megaSoftware分析megaFile总是显示错误 。megaMolecule进化遗传分析此词条为多义词，五感MEGA的全称是molecular Revolution ary genic Analysis进化遗传-2 。

推断发生学，挖掘网络数据库，估计分子进化的程度 ， 测试进化假说 。Mega可用于序列比对 ， 进化树推断，分子估计进化 speed，验证-1 。
7、 mega 进化树树枝有的没有【mega 6进化树分析,如何用mega构建进化树】mega进化树枝有或没有Mega 进化树枝一般指神奇宝贝进化过程中的各个阶段，比如从小龙到大龙 。Mega 进化树上有树枝吗？答案是肯定的，Mega 进化树的分支是存在的，Mega 进化 Tree是一个特殊的进化 Tree，它的分支由许多不同的特殊技能组成，每一个技能都属于一个特定的宝藏梦，而这些宝藏梦可以通过特殊的方式获得这些技能进化 。

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