甲基华套路与甲基华有关 。甲基转化甲基定量DMP(或DML ， 差分甲基转化部位)与DMR(差分甲基转化区域)关系的一些初步知识 ， 可以了解一下甲基华:450k 甲基华基金会450K 甲基华芯片数据处理门户450k 甲基华芯片常用工具包:ChAMP和minfi等，这个包可以为甲基 data做两件事:DSS包对差异甲基 data的检测是基于β负二项分布的严格Wald检验 。
1、纯生信 分析套路综述|癌症中m6A与非编码RNA之间相互作用新见解说起中国自然研究的新宠“m6A 甲基 modification”，想必大家都不陌生 。m6A 甲基修饰是所有RNA中最常见的表观遗传修饰 ， 包括mRNA和ncRNA(即非编码RNA，包括miRNA、rRNA、circRNA和lncRNA) 。越来越多的证据表明 ， m6A 甲基的修饰在各种生理和病理过程中起着至关重要的作用 。今天给大家分享一篇发表在molecular cancer(IF:15.302:15.302)上的综述文章，关于癌症中m6A和ncRNA的相互作用 。
2、【2020-7NG】晚期前列腺癌的DNA 甲基化landscape Summary: 1)通过对100例去势抵抗性前列腺癌转移灶的全基因组、全甲基 chemogroup和全转录组测序 ， 发现了新的驱动基因变化 。这些变化只能通过整合的全基因组方法来检测 。2)建立CMP 甲基分子分型，22%的肿瘤TET2、DNMT3B、IDH1和BRAF高甲基分子分型和体细胞突变与CMP分型相关 。
4)前列腺癌驱动基因AR、MYC和ERG基因的甲基修饰与RNA表达显著相关 。5)首次大规模综合研究转移性前列腺癌，全面总结了甲基化疗在转移性去势抵抗性前列腺癌中的重要调节作用 。虽然DNA 甲基转化是基因表达的关键调控者，但转移癌的全基因组甲基转化从未被检测到 。通过对100例抗去势前列腺转移瘤的WGBS、WGS和RNAseq的分析 ， 我们发现了影响驱动基因的变化，这些变化只有通过整合WGS才能检测到 。
3、胶质瘤文献1:脑干胶质瘤的整合基因组和表观基因组图谱【甲基化分析图,cbioportal甲基化分析】 Title:脑干胶质瘤的integratedomicandepigenomics landscape期刊:naturecommunications影响因子:14.912发表时间:2020摘要脑干胶质瘤是一组异质性肿瘤，既包括手术切除治愈的良性肿瘤，也包括无有效治疗的高致死性肿瘤 。本文对一大组脑干胶质瘤(包括弥漫性固有桥脑胶质瘤)进行了综合研究 ， 包括表观遗传学和基因组分析 。
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