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r语言的相关性分析

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如何使用r 语言 Go 分析一个基因和所有基因相关性如果空格用NA表示，可以通过下面的编码来实现 。假设第一组数据为a1，第二组数据为a2，R 语言计算两组数据变量之间的相关系数和P值的一个简单例子是论文《国际个人非编码RNAs的比较分析》和《园艺研究中长编码RNAs的表征》，在eatstressinChinesecabbage的方法部分，写着这相当于在两个数据集中的变量之间计算相关性，我发现R包里的函数correlation()以前可以做，但是在这里遇到了一个问题，关闭这个错误界面后会提示我暂时不知道怎么解决 。我自己搜了一下，还没找到解决办法，只能把输入法切换到中文，然后一次性输入函数名，计算相关系数和P值，结果如下，但是mRNA表达有上万条 ， 用这个函数计算的时候，找另一个函数很慢，就是Hmisc包里的rcorr()函数 ， 速度快很多，但是他不能计算两个数据集之间的变量的相关性，所以他可以先计算 ， 然后过滤这个函数需要的输入数据是矩阵格式，自定义函数把这个结果转换成四列的 。
1、R 语言计算两组数据变量之间相关系数和P值的简单小例子例如，在园艺研究中，论文比较分析了等长非编码国际化精子和长编码国际化反应集的特征 。Ge方法部分写道，这相当于在两个数据集中的变量之间计算相关性 。我发现R包里的函数correlation()以前可以做，但是在这里遇到了一个问题 。关闭这个报错界面后，会提示暂时不知道怎么解决 。我自己搜了一下，还没找到解决办法 ， 只能把输入法切换成中文了 。然后一次性输入函数名，计算相关系数和P值，结果如下 。但是mRNA表达式有几万个，用这个函数计算非常慢 。另一个函数是Hmisc的包中的rcorr()函数，这个函数要快很多，但是它不能计算两个数据集之间的变量的相关性 。在这种情况下 ， 可以先进行计算，然后将该函数所需的输入数据筛选为矩阵格式自定义函数，将该结果转换为一个 。
2、利用r 语言 相关性检验结果可能为0吗1 。两个变量都是多分类的 。这时候一般称为分析变量之间的相关性 。此时的数据一般是一个数据帧或者矩阵结构的频率表，可以直接使用chisq.test()命令进行处理，比如> chisq.test(bird.df) 。如果频率表中的频率为0 ， 将输出一条错误消息:chisquare approximation maybe incorrect 2 。两个变量都是二元的 。此时的数据是一个2*2的列联表，chisq.test()会默认使用Yates连续性修正，可以通过corrctTRUE关闭 。实际上chisq.test()只会对2*2列联表使用Yates校正 。
3、如何用r 语言去 分析一个基因跟所有基因的 相关性【r语言的相关性分析】如果空格用NA表示，可以通过下面的编码来实现 。假设第一组数据是a1，第二组数据是a2，它们的行是一样的！索引.自变量的筛选是根据其卡方显著性自动生成父节点和子节点，卡方显著性越高，越早成为预测根节点的变量(建模需要的变量)，程序自动合并不同类别的预测变量 。

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