matlab遗传算法先收敛后发散|matlab遗传算法先收敛后发散,遗传算法及其MATLAB实现

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遗传算法及其MATLAB实现
(2006-04-29 08:52:47)
遗传算法及其MATLAB实现
主要参考书:
MATLAB 6.5 辅助优化计算与设计 飞思科技产品研发中心编著
电子工业出版社 2003.1
遗传算法及其应用 陈国良等编著
人民邮电出版社 1996.6
主要内容:
?遗传算法简介
?遗传算法的MATLAB实现
?应用举例
在工业工程中,许多最优化问题性质十分复杂,很难用
传统的优化方法来求解.自1960年以来,人们对求解这类难
解问题日益增加.一种模仿生物自然进化过程的、被称为“
进化算法(evolutionary algorithm)”的随机优化技术在解这
类优化难题中显示了优于传统优化算法的性能。目前,进化
算法主要包括三个研究领域:遗传算法、进化规划和进化
策略。其中遗传算法是迄今为止进化算法中应用最多、比较
成熟、广为人知的算法。
一、遗传算法简介
遗传算法(Genetic Algorithm, GA)最先是由美国Mic-
hgan大学的John Holland于1975年提出的。遗传算法是
模拟达尔文的遗传选择和自然淘汰的生物进化过程的计算
模型。它的思想源于生物遗传学和适者生存的自然规律,
是具有“生存+检测”的迭代过程的搜索算法。遗传算法
以一种群体中的所有个体为对象,并利用随机化技术指
导对一个被编码的参数空间进行高效搜索。其中,选择、
交叉和变异构成了遗传算法的遗传操作;参数编码、初始
群体的设定、适应度函数的设计、遗传操作设计、控制参
数设定等5个要素组成了遗传算法的核心内容。
遗传算法的基本步骤:
遗传算法是一种基于生物自然选择与遗传机理的随机
搜索算法,与传统搜索算法不同,遗传算法从一组随机产
生的称为“种群(Population)”的初始解开始搜索过程。种
群中的每个个体是问题的一个解,称为“染色体(chromos
ome)”。染色体是一串符号,比如一个二进制字符串。这
些染色体在后续迭代中不断进化,称为遗传。在每一代中
用“适值(fitness)”来测量染色体的好坏,生成的下一代染
色体称为后代(offspring)。后代是由前一代染色体通过交
叉(crossover)或者变异(mutation)运算形成的。
在新一代形成过程中,根据适度的大小选择部分后代,淘
汰部分后代。从而保持种群大小是常数。适值高的染色体
被选中的概率较高,这样经过若干代之后,算法收敛于最
好的染色体,它很可能就是问题的最优解或次优解。
主要步骤如下所示:
(1)编码:GA在进行搜索之前先将解空间的解数据表示成
遗传空间的基因型串结构数据,这些串结构数据的不同组
合便构成了不同的点。
(2)初始群体的生成:随机产生N个初始串结构数据,每个
串结构数据称为一个个体,N个个体构成了—个群体。
GA以这N个串结构数据作为初始点开始迭代。
(3)适应性值评估检测:适应性函数表明个体或解的优劣性。
对于不同的问题,适应性函数的定义方式也不同。
(4)选择:选择的目的是为了从当前群体个选出优良的个体
,使它们有机会作为父代为下一代繁殖子孙。遗传算法通
过选择过程体现这一思想,进行选择的原则是适应性强的
个体为下一代贡献一个或多个后代的概率大。选择实现了
达尔文的适者生存原则。
(5)交叉:交叉操作是遗传算法中最主要的遗传操作。通过
交叉操作可以得到新一代个体,新个体组合了其父辈个体
的特性。交叉体现了信息交换的思想。
(6)变异:变异首先在群体中随机选择一个个体,对于选中
的个体以一定的概率随机地改变串结构数据中某个串的值。
同生物界一样,GA中变异发生的概率很低,通常取值在
0.001~0.01之间。变异为新个体的产中提供了机会。
实际上,遗传算法中有两类运算:
● 遗传运算:交叉和变异
● 进化运算:选择
GA的计算过程流程图
遗传算法的特点
GA是对问题参数的编码组进行计算,
而不是针对参数本身。
GA的搜索是从问题解的编码组开始搜素、
而不是从单个解开始。
GA使用目标函数值(适应度)这一信息进行搜索,
而不需导数等其他信息。
GA算法使用的选择、交叉、变异这三个算子都是随机操作,
而不是确定规则。
举例图解说明计算流程
二、遗传算法的MATLAB实现
需要如下主函数:
编码和种群生成
function [pop] = initializega(num,bounds,evalFN,evalOps,options)
% pop - the initial, evaluated, random population
% num - the size of the population, i.e. the number to create
% bounds - the number of permutations in an individual (e.g., number
% of cities in a tsp
% evalFN - the evaluation fn, usually the name of the .m file for evaluation
% evalOps- any options to be passed to the eval function defaults [ ]
% options- options to the initialize function, ie. [eps, float/binary, prec]
% where eps is the epsilon value and the second option is 1 for
% orderOps, prec is the precision of the variables defaults [1e-6 1]
交叉
function [c1,c2] = arithXover(p1,p2,bounds,Ops)
% Arith crossover takes two parents P1,P2 and performs an interpolation
% along the line formed by the two parents.
%
% function [c1,c2] = arithXover(p1,p2,bounds,Ops)
% p1 - the first parent ( [solution string function value] )
% p2 - the second parent ( [solution string function value] )
% bounds - the bounds matrix for the solution space
% Ops - Options matrix for arith crossover [gen #ArithXovers]
选择
normGeomSelect:NormGeomSelect is a ranking selection
function based on the normalized geometric distribution.
(基于正态分布的序列选择函数)
变异
function[newPop] = normGeomSelect(oldPop,options)
% NormGeomSelect is a ranking selection function based on
the normalized
% geometric distribution.
%
% function[newPop] = normGeomSelect(oldPop,options)
% newPop - the new population selected from the oldPop
% oldPop - the current population
% options - options to normGeomSelect
[gen probability_of_selecting_best]
一些辅助函数:
f2b :Return the binary representation of the float number
fval(将浮点数转化为二进制数)
b2f:Return the float number corresponing to the binary
representation of bval. (将二进制数转化为
浮点数)
nonUnifMutation: Non uniform mutation changes one
of the parameters of the parent based on a non-uniform
probability distribution. This Gaussian distribution starts wide,
and narrows to a point distribution as the current generation
approaches the maximum generation.
(基于非均一概率分布进行非均一变异)
maxGenTerm:Returns 1, i.e. terminates the GA when the
maximal_generation is reached.
(当迭代次数大于最大迭代次数时,终止遗传算法,返回
为1,否则返回为0。)
roulette:roulette is the traditional selection function with the
probability of surviving equal to the fittness of i / sum of the
fittness of all individuals
三、应用举例
1.计算下列函数的最大值。
f(x)=x+10*sin(5x)+7cos(4x) , x∈[0,9]
方式1 >>gademo
方式2
step 1 编写目标函数gademo1eval1.m
function [sol, val] = gaDemo1eval_r(sol,options)
x=sol(1);
val = x + 10*sin(5*x)+7*cos(4*x);
step 2 生成初始种群,大小为10
initPop=initializega(10,[0, 9],'gademo1eval1',[],[1e-6,1]);
step 3 25次遗传迭代
[x, endPop,bpop,trace] = ga([0 9],'gademo1eval1',[],initPop,...
[1e-6 1 1],'maxGenTerm',25,...
'normGeomSelect',[0.08],...
['arithXover'],[2],...
'nonUnifMutation',[2, 25 ,3])
% Output Arguments:
% x - the best solution found during the course of the
run
% endPop - the final population
% bPop - a trace of the best population
(解的变化)
% traceInfo - a matrix of best and means of the ga
for each generation
(种群平均值的变化)
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% Input Arguments:
% bounds - a matrix of upper and lower bounds
on the variables
% evalFN - the name of the evaluation .m function
% evalOps
- options to pass to the evaluation function ([NULL])
% startPop - a matrix of solutions that can be initialized
% from initialize.m
% opts - [epsilon, prob_ops ,display]
change required to consider two solutions
different, prob_ops 0 if you want to apply the
% genetic operators probabilisticly to each solution,
1 if you are supplying a deterministic number
of operator applications and display is 1 to output
progress 0 for quiet. ([1e-6 1 0])
% termFN - name of the .m termination function
(['maxGenTerm'])
% termOps - options string to be passed to the termination
function ([100]).
% selectFN - name of the .m selection function
(['normGeomSelect'])
% selectOpts - options string to be passed to select after
% select(pop,#,opts) ([0.08])
% xOverFNS - a string containing blank seperated names
of Xover.m files (['arithXover heuristicXover
simpleXover'])
% xOverOps - A matrix of options to pass to Xover.m files
with the first column being the number of that
xOver to perform similiarly for mutation
([2 0; 2 3; 2 0])
% mutFNs - a string containing blank seperated names of
mutation.m files (['boundaryMutation
multiNonUnifMutation ...
% nonUnifMutation unifMutation'])
% mutOps - A matrix of options to pass to Xover.m files
with the first column being the number of that
xOver to perform similiarly for mutation
([4 0 0; 6 100 3; 4 100 3; 4 0 0])
2.求sin(x) 在0到3.14之间的最大值.
function [sol, val] = sin1(sol,options)
x=sol(1);
val =sin(x);
initPop=initializega(10,[0, 3.14],'sin1',[],[1e-6,1]);
[x, endPop,bpop,trace] = ga([0 3.14],'sin1',[],initPop,...
[1e-6 1 1],'maxGenTerm',25,...
'normGeomSelect',[0.08],...
['arithXover'],[2],...
'nonUnifMutation',[2, 25 ,3])
3. binaryExample.m
二元函数例子 二进制编码
方式1 >> binaryExample
方式2
function [sol,val] = gaMicheval_r(sol,options)
val = 21.5 + sol(1) * sin(4*pi*sol(1)) + sol(2)*sin(20*pi*sol(2));
%%%%%%%%%%%%%%
global bounds
% Setting the seed back to the beginning for comparison sake
rand('seed',0)
% Crossover Operators
xFns = 'simpleXover';
xOpts = [.4];
% Mutation Operators
mFns = 'binaryMutation';
mOpts = [0.005];
% Termination Operators
termFns = 'maxGenTerm';
termOps = [200]; % 200 Generations
% Selection Function
selectFn = 'roulette'
selectOps = [];
% Evaluation Function
evalFn = 'gaMichEval';
evalOps = [];
% Bounds on the variables
bounds = [-3, 12.1; 4.1, 5.8];
% GA Options [epsilon float/binar display]
gaOpts=[1e-6 0 1];
% Generate an intialize population of size 20
startPop = initializega(20,bounds,'gaMichEval',[],[1e-6 0]);
[x endPop bestPop trace]=ga(bounds,evalFn,evalOps,startPop,gaOpts,...
termFns,termOps,selectFn,selectOps,xFns,xOpts,mFns,mOpts);
% x is the best solution found
x
% endPop is the ending population
endPop
% trace is a trace of the best value and average value of generations
trace
clf
plot(trace(:,1),trace(:,2));
hold on
plot(trace(:,1),trace(:,3));
% Lets increase the population size by running the defaults
%
rand('seed',0)
termOps=[100];
[x endPop bestPop trace]=ga(bounds,evalFn,evalOps,[],gaOpts,termFns,termOps,...
selectFn,selectOps);
% x is the best solution found
x
% endPop is the ending population
%endPop
% trace is a trace of the best value and average value of generations
%trace
% Plot the best over time
clf
plot(trace(:,1),trace(:,2));
% Add the average to the graph
hold on
plot(trace(:,1),trace(:,3));
4. floatExample.m
二元函数例子 浮点编码
global bounds
% Setting the seed to the same for binary
rand('seed',156789)
% Crossover Operators
xFns = 'arithXover heuristicXover simpleXover';
xOpts = [1 0; 1 3; 1 0];
% Mutation Operators
mFns = 'boundaryMutation multiNonUnifMutation nonUnifMutation unifMutation';
mOpts = [2 0 0; 3 200 3; 2 200 3; 2 0 0];
% Termination Operators
termFns = 'maxGenTerm';
termOps = [200]; % 200 Generations
% Selection Function
selectFn = 'normGeomSelect';
selectOps = [0.08];
% Evaluation Function
evalFn = 'gaMichEval';
evalOps = [];
% Bounds on the variables
bounds = [-3 12.1; 4.1 5.8];
% GA Options [epsilon float/binar display]
gaOpts=[1e-6 1 1];
% Generate an intialize population of size 20
startPop = initializega(20,bounds,'gaMichEval',[1e-6 1])
[x endPop bestPop trace]=ga(bounds,evalFn,evalOps,startPop,gaOpts,...
termFns,termOps,selectFn,selectOps,xFns,xOpts,mFns,mOpts);
% x is the best solution found
x
% endPop is the ending population
endPop
% bestPop is the best solution tracked over generations
bestPop
% Plot the best over time
clf
plot(trace(:,1),trace(:,2));
% Add the average to the graph
hold on
plot(trace(:,1),trace(:,3));
% Lets increase the population size by running the defaults
[x endPop bestPop trace]=ga(bounds,evalFn,evalOps,[],gaOpts);
% x is the best solution found
x
% endPop is the ending population
endPop
% bestPop is the best solution tracked over generations
bestPop
% Plot the best over time
clf
plot(trace(:,1),trace(:,2));
% Add the average to the graph
hold on
plot(trace(:,1),trace(:,3));
5. 求解货郎担问题(TSP)
orderBasedExample.m
6. 求解非线性规划问题
max f(x)
s.t. gi(x)<=0,i=1,...,m
hi(x)=0,i=m+1,...,n
x∈Ω
?不可行的后代?
?拒绝策略
?修复策略
?改进遗传算子策略
?惩罚策略
e.g. min f(x)=(x1-2)2+(x2-1)2
s.t. g1(x)=x1-2x2+1>=0
g2(x)=x12/4-x22+1>=0
分析:取加法形式的适值函数:
val(x)=f(x)+p(x)
惩罚函数 p(x)由两部分组成,可变乘法因子和
违反约束乘法,其表达式如下:
其中ri是约束i的可变惩罚系数。
步骤如下:
function [sol,eval]=f552(sol,options)
x1=sol(1);
x2=sol(2);
r1=0.1;
r2=0.8;
%约束条件
g1=x1-2*x2+1;
g2=x1.^2/4-x2.^2+1;
%加惩罚项的适值
if (g1>=0)&(g2>=0)
eval=(x1-2).^2+(x2-1).^2;
else
eval=(x1-2).^2+(x2-1).^2+r1*g1+r2*g2;
end
eval=-eval;
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%维数n=2
%设置参数边界
bounds = ones(2,1)*[-1 1]; %??????
%遗传算法优化
[p,endPop,bestSols,trace]=ga(bounds,'f552');
p
%性能跟踪
plot(trace(:,1),trace(:,3),'b-')
hold on
plot(trace(:,1),trace(:,2),'r-')
xlabel('Generation');
ylabel('Fittness');
legend('解的变化','种群平均值的变化');
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