分析内容:提供感兴趣的目标基因列表(一个或多个) ， 分析对照目标基因转录因子；或者提供感兴趣的转录 因子 ， 分析受其调控的目标基因信息 。基因转录调控网络描述转录 因子与被调控基因的关系，转录 因子结合位点是如何分析转录因子结合位点的具体检测比较复杂，但大致可以这样描述:转录 因子转录因子结合位点(TFBS)是转录 因子调控基因表达时与基因模板链结合的区域 。
1、SCENIC:单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络和细胞功能聚类SCENIC算法2017年发表在NatureMethods杂志上，利用单细胞RNAseq数据，同时重构基因调控网络和识别细胞状态，应用于肿瘤和小鼠大脑单细胞图谱数据 ， 提出并证明了顺式调控网络分析可用于指导转录-1 。SCENIC通过使用生物学驱动的功能，自动消除肿瘤样本特异性等批次效应 。
【转录因子分析软件】对一般分子网络的背景有一些了解 。细胞的转录状态来自于潜在的基因调控网络，GRN由有限数量的转录 因子(TFs)和辅助因子组成，相互调控和调节下游的靶基因 。单细胞转录group分析的最新发展为转录 state的高分辨率识别和状态间的跃迁提供了令人振奋的机会 。例如 ， 在分化过程中针对单细胞RNAseq优化的统计和生物信息学方法带来了新的生物学见解 。
2、科研人员调控花期的基因“枢纽”,你有哪些了解?我知道一点，主要是调节人体细胞的变化和调节，有利于各种疾病的控制和治疗 ， 而且这项研究具有特别高的生物学和应用价值，已经取得了很大的成果 。转录 因子它相当于基金的一个调控开关，让细胞做出相应的改变，同时操纵细胞内的调控信号 。转录 因子可以理解为基因表达的调控开关 。基因表达的调节与整个细胞的变化有关 。医学研究人员正在试图了解和操纵细胞中的各种调节信号，这可能是找到某些疾病新治疗方法的有效途径 。
伊利诺伊大学芝加哥分校的一个研究小组基于机器学习算法开发了一个软件系统，称为贝叶斯推理因子活动模型 。该系统可以帮助科学家更有效地从数据中识别基因转录 因子，并预测哪个转录 因子在单个细胞中最活跃 。研究人员在肺、心脏和脑组织细胞中测试了该系统 。单细胞测序是一种强大的实验技术 ， 用于研究组织中单个细胞的转录 group异质性，识别具有不同生物学功能的新细胞亚群 。
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