如何使用mega比较多个序列分析使用mega5为已知的多个序列制作进化树NJ图和MP图？我更多地使用对齐而不是多序列 。推荐一些软件，分子生物学软件mega如何得到序列的碱基组成及其百分比，用HhaI和HaeIII限制性酶消化扩增产物 。
1、同一植物 蛋白序列进化树结果怎么看你要做的是在一个物种中找到一个基因在另一个物种中的直向同源，然后做种系发生树的那种 。可以做多序列比对的软件很多，我用比对的比多序列比对的多 。给你推荐几个软件，一个是clustalx，一个是MEGA，两个都可以/11 。
2、利用ncbi查询 蛋白质,可以获得protein的什么信息?可以找到蛋白的二级结构的组成，这样它的化学特征就可以是分析 。1.系统发育树分析 。利用基因序列和氨基酸序列构建系统进化树；2.如果已经有了木聚糖酶的三维或四维结构，可以定性模拟蛋白的构象 。其他的我都不记得了 。补充:1 。进化树分析不仅仅是一个比较，而是蛋白进化过程的图谱 。建议查看相关期刊 。2.有专门的软件做3D和4D结构，但是必须用已知结构的同源性蛋白作为建模的基础 。
3、怎样 分析系统进化树问题1:如何理解进化树？在生物学中 ， 进化树用来表示物种之间的进化关系 。生物分类学家和进化论者把各种生物按照它们亲缘关系的远近放在一个分支的树形图上，简明地表示了生物的进化过程和亲缘关系 。进化树上的每个叶节点代表一个物种 。如果给每条边一个适当的权重，那么两个叶节点之间的最短距离可以表示两个对应物种之间的差异 。
希望对你有帮助 。问题2:如何分析这个系统的进化树图？有图 。求大侠指点？从序列的进化关系来看 ， 10点的节点是一个新物种 。因此可以看出，19在已鉴定的菌株中没有出现过，是一个新种 。从进化的角度分析 。9属于一个集群，进化关系密切 。靠近底部的物种群 。根据以上结果，可以进一步做生理生化鉴定，确认物种 。问题3:我做了一个进化树 。我是怎么做的进化树分析？我是怎么做的进化树分析？生物进化是指所有生命形式的进化过程 。
4、分子生物学软件 mega怎样得到序列的碱基组成及其百分比用HhaI和HaeIII限制性内切酶消化扩增产物 。(4)加入50 ul的5 mol/:24，然后加入50 ul的CTAB/，最后用MEGA6建立比对得到的所有序列的进化树 。9: (1)取1；离心5分钟 ， 将上清液转移到新的EP管中，干燥，小心倒置混合并彻底混合；TEBuffer溶解的DNA 4℃保存，50℃孵育1小时，酶带分型确定操作单位 。Min)培养16小时 ， 克隆选择和PCR鉴定，重复洗涤一次，将上清液转移到新的EP管中，重复此步骤23次，12000 r/:从每个操作单元选取一个菌株的16SrDNA进行连接实验；氯化钠溶液:异戊醇(24 。
5、如何用 mega做多重序列比对 分析【mega 蛋白 分析,蛋白对接结果分析】使用mega5制作已知多个序列的进化树NJ图和MP图 。邻接距离矩阵法(NJ)是系统发育树构建中应用最广泛的方法，可以快速构建系统发育树，也适用于分析较大的数据集，可以快速进行自扩展测试，但缺点是分析的进化距离不能太大，最大简约法(MP)在处理核苷酸替换时不需要距离法或似然法所必需的假设，因此当序列散度较低时 ， MP方法可以用来获得更可靠的系统发育树 。
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