PLS和OPLS 分析代谢组学数据主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是对样本数较多或变量间存在多重共线性的组学数据进行可视化、回归、分类和特征选择的常用方法 。文献阅读-自噬调节烟草花粉管的正常萌发，这篇精读是今年1月26日发表在Autofagy网上的一篇文章，作者简介:武汉大学孙教授，主要从事被子植物生殖发育生物学和生殖细胞工程研究 。
1、文献阅读--自噬调控烟草花粉管的正常萌发【waters oplsda分析,oplsda分析是几组数据】这个精读的文献是今年1月26号在《自噬》上在线发表的一篇文章 。作者简介:武汉大学孙教授，主要从事被子植物生殖发育生物学和生殖细胞工程研究 。本研究证明了自噬途径参与了烟草花粉的正常萌发 。在前期烟草自噬基因的鉴定中 ， 作者发现与自噬相关的ATGs在花粉萌发期表达量大幅增加，在成熟花粉中达到最大值，提示自噬可能参与植物的正常生长发育 。
幸运的是，作者通过各种手段发现花粉萌发过程中自噬活性大大增强 。萌发后30分钟，透射电镜观察到自噬体 。当使用ConA(伴刀豆球蛋白A ， 它可以酸化液泡并防止自噬体降解)时 ， 发现自噬体富集在萌发孔附近的液泡中 。光学显微镜下用ATG8特异性抗体标记的自噬体进行免疫分析，发现自噬体在萌发孔处有明显的点状聚集 。
2、用PLS和OPLS 分析代谢组数据主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是变量个数超过样本个数或变量间存在多重共线性的组学数据可视化、回归、分类和特征选择的常用方法 。PLS和正交偏最小二乘(OPLS)是监督模型 ， 他们利用偏最小二乘回归建立代谢物表达与样本类别的关系模型，实现对样本类别的预测 。OPLS是一种造型方法，相比之下，OPLS可以分别模拟相关因素和无关变量 。虽然计算方法与PLS相同，但OPLS更能说明问题 。
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