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关联分析 ld 计算,灰色关联度分析计算

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关联算法关联是指关联分析 ， 第九章数据关联规则分析算法-基于Apriori算法的关联项分析9.1基于Apriori算法的关联分析Aprior算法是一种关联规则 。然后 ， 没有好的工具计算性染色体协会分析，随着遗传学研究的发展 ， 有许多工具允许计算性染色体的关联分析 。

1、群体遗传 分析—LD连锁不平衡当一个基因座的某个特定等位基因和另一个基因座的某个等位基因同时出现的概率大于群体中随机分布的两个等位基因同时出现的概率时，称这两个基因座处于连锁不平衡状态 。d是LD(连锁不平衡)的基本单位，衡量观察到的单体型频率与平衡时预期频率之间的偏差 。虽然D可以很好地表达LD的基本含义，但它不适合表达实际的LD强度，尤其不适合用于不同研究中LD值的比较，因为它严格依赖于等位基因频率 。
【关联分析 ld 计算,灰色关联度分析计算】
LD 计算的方法如下:1 。有两个基因座(A，B)，等位基因分别为A，A，B and B，分别对应群体中f(A)，f(a)，f(B)，F (B)的频率 。在这两个基因座中有四种单倍型AB和Ab 。当Dab≠0时，处于链条不平衡状态 。

2、2021-01-27林木全基因组关联 分析(GWAS1 。林木的目标改良性状多为数量性状，在全基因组水平上由多个基因位点共同控制 。它们的遗传变异效应可分为基因的加性和显性效应、基因的上位性效应和基因环境的互作效应 。以前应用基于家系群体的数量性状基因座作图分析方法，在林木复杂性状的遗传分析方面取得了显著进展 。2.然而，由于大部分树系作图是基于低代杂种群体如F1、F2或BC1，遗传变异丰富度低，染色体重组事件有限 。

3.基于自然群体或种质资源的关联遗传策略为分析数量性状的遗传基础提供了新的途径 。4.关联分析，又称连锁不平衡(LD)作图，可以直接利用自然群体中丰富的表型和基因组变异来确定控制数量性状的目标基因 。特别是多年生森林类群在适应复杂多变的自然环境过程中产生了丰富的表型变异和DNA序列变异，是研究相关作图的理想材料 。

3、连锁不平衡(LD连锁不平衡(LD)是指不同基因座等位基因的非随机关联 。LD的衰减受复合率和复合代数的影响 。研究LD的衰变可以揭示基团复合的历史 。如果位于同一染色体上的两个等位基因(AB)同时存在的概率大于在群体中随机分布的概率 ， 则称这两个等位基因处于LD状态 。通常，D 和r2是LD测量中最常见的 。当D0，r20时，处于完全联动平衡状态；当D1 ， r21时，它处于完全联动不平衡状态 。

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