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差异甲基化分析,全基因组甲基化分析

睿知经验分享

如何找到印记基因的差异 甲基位点，即CpG岛 ， 一般是以下几种方法:1 .MSP，亚硫酸氢盐转化法被认为是DNA 甲基 1234566 。我看了各种文献，总结了DNA 甲基文化研究的十个核心问题，包括什么是DNA 甲基文化，DNA的主要形式甲基转化，DNA的主要功能甲基转化和去除甲基转化，植物中的DNA 甲基转化，DNA 甲基转化，-0/的主要研究方向，DNA 甲基的检测方法 ， 如何选择DNA 甲基的检测技术以及DNA 甲基的数据挖掘等，，好让你了解DNA 。

1、【2020-7NG】晚期前列腺癌的DNA 甲基化landscape Summary: 1)通过对100例去势抵抗性前列腺癌转移灶的全基因组、全甲基 chemogroup和全转录组测序，发现了新的驱动基因变化 。这些变化只能通过整合的全基因组方法来检测 。2)建立CMP 甲基分子分型，22%的肿瘤TET2、DNMT3B、IDH1和BRAF高甲基分子分型和体细胞突变与CMP分型相关 。

4)前列腺癌驱动基因AR、MYC和ERG基因的甲基修饰与RNA表达显著相关 。5)首次大规模综合研究转移性前列腺癌，全面总结了甲基化疗在转移性去势抵抗性前列腺癌中的重要调节作用 。虽然DNA 甲基转化是基因表达的关键调控者，但转移癌的全基因组甲基转化从未被检测到 。通过对100例抗去势前列腺转移瘤的WGBS、WGS和RNAseq的分析，我们发现了影响驱动基因的变化，这些变化只有通过整合WGS才能检测到 。

2、易基因|精准医学:DNA 甲基化图谱在发现和精确诊断神经肿瘤领域的应用...近年来 ， 中枢神经系统(CNS)肿瘤的分类越来越客观，越来越依赖于生物认知 。尽管过去的分子诊断包括特异性突变、拷贝数改变或基因融合，但DNA 甲基测序的发展显著提高了诊断的准确性，增加了可靠性，并为发现新的肿瘤类型提供了思路 。大多数情况下，基因突变/融合与DNA 甲基转化密切相关 。在这篇综述中，作者强调了DNA 甲基 map在中枢神经系统肿瘤分类中的作用，重点介绍了几种肿瘤类型以及DNA 甲基 map对当前肿瘤分类的贡献 。
【差异甲基化分析,全基因组甲基化分析】
限制性内切酶消化、亲和富集方法，例如-0 DNA免疫沉淀(MeDIP)和电化学检测都是用于测定全基因组甲基的方法 。基因组DNA的亚硫酸盐测序是最常用的方法 。亚硫酸氢钠可以将非甲基的胞嘧啶转化为尿嘧啶 ， 还有全基因组亚硫酸盐测序(WGBS)技术 。图1总结了DNA 甲基 map的诊断应用及其在外科神经病理学中的作用 。

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