【基因分析中GO号是什么】基因的过表达围棋术语是什么?GO enrichment分析GO enrichment是组学数据分析中常用的方法,通常用于探究GOterm在difference 基因中的富集程度 。很多人解释的比较清楚,比如GO 分析学习笔记,耿氏基因Expression分析(中)Enrichment 分析,转录组导论(八):Enrichment,关于是否有必要构建的问题,我看到徐洲在如何丰富分析的函数注释后提到“你不需要构建一个Orgdb,因为Orgdb的目的是转换基因 numbering和GO/KEGG 。
1、一文极速读懂GeneOntology(GOOfficial:基因Ontology(GO)知识库是世界上最大的关于基因 function的信息源 。这些知识不仅人类可读,机器也可读,是生物医学研究中大规模分子生物学和遗传学实验计算的基础分析 。在了解基因 GeneOntology之前 , 我们先来看看什么是本体论:本体论是探索世界的本源或矩阵的哲学理论 。本体论通常处理的问题是:存在什么本质,如何对这些本质进行分组,如何在层次结构内将它们联系起来,如何根据异同进行细分 。
基因 Ontology (GO)从三个方面描述了我们对生物学领域的理解:我们对上述概念的理解,现在举个例子,如果我们从基因 Ontology GO的角度来解释a-0:/12344 。例如,许多同义词被指定为系统同义词 。
2、请问 基因本体论怎么解释基因ontology(GO)是生物信息学领域广泛使用的本体 。主要包括细胞成分、分子功能和生物过程三个分支 。基因本体是有向无环图(DAG)类型的本体 。目前GO使用两种关系:is_a和part_of 。在生物信息学领域 , 搜索信息的主要瓶颈之一是不同的生物数据库可能使用不同的术语,这使得信息搜索非常复杂,特别是使机器搜索更加困难 。
基因本体论就是为了解决这个问题而发起的项目 。基因本体论包括三个领域:细胞成分、细胞各部分和细胞外环境 。分子功能,基因产品在分子水平上的主要活性 , 如结合和催化 。生物过程,发生在细胞中的事件或行为,可以定义开始和结束 。
3、GO和KEGG的区别两者的具体区别一直不清楚,只知道基因在代谢上比较丰富 。前者是函数注,即每个基因可能参与哪些pathwayterms或GOterms,没有门槛,后者是函数丰富化,即基因set(multiple基因)可能侧重于哪些函数,比如选择p 。
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