Linux查看和去除文件的空行做Coregenome SNP分析时,有时参考基因组的pep文件有空行,总是导致分析过程中出错,最后获取不到coreSNP信息 。遇到几次 , 每次都是打开pep文件逐行查看是否有空行 。这次记录下上次的解决方案,备后续使用 。还是整理成脚本,每次跑程序前过滤一遍 。
此方法可以手工逐个解决空行查看和删除空行上一行后问题 。
直接提取非空行
方法三:
方法四:
Linux命令行操作之sedsed命令行格式:sed [options] 'command' file(s)
options常用选项:
-n或--quiet或——silent:仅显示script处理后的结果;
-e:以选项中的指定的script来处理输入的文本文件;
-f:以选项中指定的script文件来处理输入的文本文件;
-r∶sed 的动作支援的是延伸型正规表示法的语法;
-i∶直接修改读取的档案内容,而不是由萤幕输出;
-h或--help:显示帮助;
-V或--version:显示版本信息 。
Command常用命令:
a:新增,a 的后面可以接字符串 , 而这些字符串会在新的一行出现(目前的下一行);
c:取代 , c 的后面可以接字符串,这些字符串可以取代 n1.n2 之间的行;
d:删除,d 后面通常不接任何字符串;
i:插入,i 的后面可以接字符串 , 而这些字符串会在新的一行出现(目前的上一行);
p:列印,亦即将某个选择的资料印出 。通常 p 会与参数 sed -n 一起运作;
s:取代,可以直接进行取代的工作,通常与正规表达式搭配使用 。
实例说明:
新增操作:a命令
sed '/^bird/a\test' file将test追加到 以bird开头的行后面
删除操作:d命令
sed '/^$/d' file #删除空白行;
sed '2d' file #删除第二行;
sed '2.$d' file #删除第2行到最后一行;
sed '$d' file #删除最后一行;
sed '/^bird/'d file #删除所有开头是bird的行;
插入操作:i命令
sed -i '3i\bird ' bird.conf #在bird.conf文件第3行之前插入bird
替换文本中的字符串:s命令
sed 's/bird/birds/' file #将文本中的bird替换成birds;
sed -i 's/ bird / birds /g' file #将file文件中每一行的第一个bird替换为birds;
Linux命令之sed-删除匹配行1. sed-i '/preSql/d' a.txt
---删除匹配到 preSqllinux命令去除空行的行
2. sed -i '1d' a.txt
---删除第一行
3. sed -i '3~2d' a.txt
---从第三行开始,每隔一行删除
4. sed -i '4,8d' a.txt
---删除从第4行到第8行
5. sed -i '$d'a.txt
---删除最后一行
6. sed '/^$/d' a.txt
---删除所有空行
7. sed -i'/Website Design/,$d' a.txt
---从匹配行到末尾行
8. sed -i'/Storage/, 2d' a.txt
--- 删除匹配行和之后两行
linux删除整行命令1.连接上相应的linux主机,进入到等待输入shell指令的linux命令行状态下 。
2.用vi打开需要处理的文件,光标移动到需要删除的行 。
3.键盘按“dd”运行vi删除行指令,此时会看到之前光标移动的行被整行删除了 。
终端删除整行
ctrl u 删除命令行开始至光标处
ctrl k 删除光标处至命令行结尾
ctrl a 光标移动到最前面
ctrl e 光标移动到最后面 。
如何去掉linux配置文件的注释行和空行1、使用grep -v "^#"来去掉注释行linux命令去除空行,其中linux命令去除空行:-v就是取相反的^# 表示以#开头的行
eg. grep -v "^#" /etc/vsftpd/vsftpd.conf (也可以使用“”来重写配置文件)
2、有时也会连同空行一起去掉,使用管道符来完成(^$表示空行)
eg. grep -v "^#"httpd.conf | grep -v "^$"vsftpd.conf
上面用linux命令去除空行了 2次 grep 过滤命令,也就是把空行和注解行过滤掉,再把剩下的内容追加保存为原
来的配置文件 vsftpd.conf这个时候就文件里的内容就没有注解行和空行了,,, ,
3、备注:在更改配置文件时,建议先对配置文件做一下备份,对配置文件不熟悉的建议不要用这种方法 , 配置文件中的注解行还是有一定的帮助的 。
cp-ahttpd.confhttpd.conf.bak
linux如何清除csv文件空行linux如何清除csv文件空行?
答案如下:首先第一步打开设置linux命令去除空行 , 第二步是理解去做的方法和方式linux命令去除空行了 。
【linux命令去除空行 linux清除一行】关于linux命令去除空行和linux清除一行的介绍到此就结束了,不知道你从中找到你需要的信息了吗 ?如果你还想了解更多这方面的信息 , 记得收藏关注本站 。
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