如何打开fasta 文件？ 。fa.fna和，fasta格式相同文件？Sam tools establishmentfastaindex本文摘自:侵删！Fastq的阅读数？如何快速计算fasta以及如何用matlab对fasta基因序列进行比较分类，其实很简单 ， 但是逻辑要流畅，下面介绍如何使用samtools轻松索引fasta 文件 ， 并快速提取序列 。
【fasta文件分析,FASTA格式文件第一行】
1、八.SNP检测和进化 分析(SnippySnippy是一个SNP检测的软件，通过分析可以获得核心SNP，并进行比对构建进化树 。可以用conda来安装:也可以直接从Github安装最新版本(conda尝试了几次安装旧版本都找不到snippy multi):snippy操作的常用参数有:output 文件(outdir)、reference genome文件(ref)、Input 文件可以是单端(se)也可以是双端(R1、R2)fastqCPU数量(CPU默认为8个)的具体详细参数如下:shell脚本也可以由snippymulti 文件批处理执行生成，snippymulti input 文件包含:将获得的run_snp.sh脚本逐一执行 ， 如果服务器性能良好 ， 可以修改脚本，在snippy命令行添加:nohup
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