细菌|Nature:探索细菌治疗癌症的新方法
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各种细菌物种是已知的定殖于人类肿瘤内 。它们增殖并调节免疫功能,这最终会影响癌症患者的生存及其对治疗的反应 。然而,尚不清楚源自细胞内细菌的抗原是否由肿瘤细胞的人白细胞抗原I和II类(分别为HLA-1和HLA-II)分子呈递,或此类抗原是否引起肿瘤浸润性T细胞免疫反应 。
基于此,以色列魏茨曼科学研究所Yardena Samuels教授带领团队,使用16S rRNA基因测序和HLA肽组学来鉴定源自细胞内细菌的肽库,该肽库已出现在黑素瘤肿瘤中的HLA-I和HLA-II分子上 。相关研究成果在线发表在《Nature》杂志上 。
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该研究团队将加载的B细胞与自体TIL共培养,并通过使用流式细胞仪分析TIL反应性以检测分泌IFNγ的TIL 。与未装载这些肽的对照B细胞相比,该研究团队检测到八种不同细菌肽的IFNγ分泌TIL增加了两倍以上 。其中包括来自患者51的七种免疫原性肽和来自患者55的一种肽 。在反应性抗原中,在患者51的两种不同转移中鉴定出一种肽(VLTDTYLTL),在患者中鉴定出两种肽(ITELNSPVL和SLTDKISII) 51和92)在两个不同的患者中进行了鉴定,在同一患者的细胞体外匹配培养中还鉴定了一种肽(患者51中的GVDLGTLTY),并从两种潜在的细菌物种中鉴定出一种肽相同的转移(ALSDMSLAL来自鞘氨醇单胞菌或甜瓜鞘氨醇单胞菌,这两个物种均在转移灶55B3中观察到) 。
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综上所述,该研究团队证明了黑色素瘤患者肿瘤中存在细菌衍生的HLA肽信号,并表征了所涉及细菌的种类 。通过应用HLA peptidomics,该研究团队证明,细菌HLA-I和HLA-II肽可以通过两者的抗原呈递细胞来呈现 。这是一个肿瘤样品分离成CD45 -和CD45 +和细菌共培养的抗原呈递细胞和黑色素瘤细胞系 。在该研究团队鉴定出的肽中,有同一患者的不同转移或不同患者的转移所共有的肽 。这些复发性抗原中的一些与HLA等位基因结合,而HLA等位基因在《癌症基因组图集》的黑色素瘤队列中非常普遍 。
参考文献
1、Kalaora, Shelly et al. “Identification of bacteria-derived HLA-bound peptides in melanoma.” Nature, 10.1038/s41586-021-03368-8. 17 Mar. 2021, doi:10.1038/s41586-021-03368-8
2、Du Toit A. Tumour cells show off bacterial peptides. Nat Rev Microbiol. 2021 Mar 25. doi: 10.1038/s41579-021-00551-6. Epub ahead of print. PMID: 33767365.
【细菌|Nature:探索细菌治疗癌症的新方法】3、Zheng, Jin Hai et al. “Two-step enhanced cancer immunotherapy with engineered Salmonella typhimurium secreting heterologous flagellin.” Science translational medicine vol. 9,376 (2017): eaak9537. doi:10.1126/scitranslmed.aak9537
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