Bandai在2002年以“水晶版”的名义改进了WSC，为这台掌机换装残影更少、面积更大的液晶屏幕 。这种小修小补救不了WSC，Bandai最终于2003年宣布停产WSC，随后正式加入GBA阵营 。
Square加盟GBA的过程最为曲折 。早在2001年1月，即日版GBA首发2个月前，Square就曾公开示好，他们表示，“WSC的机能不适合移植《最终幻想4》，Square希望将这款游戏出在GBA上” 。任天堂的老社长山内溥对此回应：“这种单方面的说辞没有任何实际效力，任天堂不会允许Square开发GBA游戏，除非《最终幻想》新作出现在任天堂的NGC主机上 。”
两家公司经过谈判，最终于2002年3月达成协议，Square为NGC开发《最终幻想：水晶编年史》，任天堂则允许Square加盟GBA平台 。无论如何，这招“挟掌机以令诸侯”的办法还是凑效了 。
Square于2003年初在GBA上推出了新作《最终幻想战略版Advance》，游戏仅日版销量就达到了90万，全球为200万 。之后Square与Enix正式合并，在GBA上炒了一堆冷饭，但也偶有新作推出 。
2004年的《王国之心：记忆之链》由Square Enix和Jupiter联合开发，Jupiter这家小公司曾外包过GBC版《樱花大战》和GBA版《索尼克弹珠台》，具备丰富的掌机游戏开发经验 。为了收录动画视频，本作使用了罕见的256Mbit大容量卡带，销量突破150万 。
《王国之心：记忆之链》在GBA上也算大手笔
至此，GBA已经把几乎全部日本第三方纳入麾下，但放眼欧美，“所有游戏在这里集结”的理论又有了新的含义 。任天堂在2002年把英国公司Rare的股权卖给了微软，此后Rare依然对GBA念念不忘，将SFC的“超级大金刚”系列移植到GBA上 。
“超级大金刚”系列的版权在任天堂手中，Rare与老东家合作炒几拨冷饭可谓情理之中 。意料之外的是，“班卓熊”和“军刀之狼”这两个系列的版权已经归属微软，依然在GBA上推出了新作 。
Rare的动作游戏《军刀之狼》
至于“古惑狼”系列，虽然索尼曾把这名角色定为PS主机的吉祥物，但其版权属于环球，而非索尼 。进入PS2时代，索尼与环球因为授权费谈判破裂，就此分道扬镳，原本的PS吉祥物走上了跨平台之路 。GBA的“古惑狼”系列变成了2D横板游戏，素质中规中矩 。
GBA的“古惑狼”系列素质尚可
至于其他欧美游戏，跨平台的障碍并非版权纠纷，而是硬件性能的差距 。为了将主机3D游戏变为掌机2D游戏，很多欧美作品为此颇费了一番功夫 。《分裂细胞》变成了横版画面，《荣誉勋章》则变成了俯视角 。尽管画面大相径庭，这些GBA作品还是尽量还原了主机版的系统，《分裂细胞》的潜入道具和《荣誉勋章》的任务系统得到了保留 。
GBA版《荣誉勋章》的画面细腻
GBA的成功自然离不开任天堂自家发行的游戏，首发游戏中销量最高的作品是《超级马力欧Advance》，这款游戏不过是美版《超级马力欧兄弟2》的复刻版，虽然增加了一点新要素，但本质上依然是冷饭，之后的几款续作也是如此 。
根据岩田聪的回忆，他在2000年进入任天堂董事会，当时他查看了GBA的首发游戏列表，其中居然看不到“马力欧”的影子，因此他建议宫本茂补上空缺，宫本茂则批准了“超级马力欧Advance”这一冷饭系列 。
宫本茂的情报开发本部是任天堂规模最大的部门，这一部门忙于NGC游戏开发，无暇顾及GBA平台 。“超级马力欧Advance”系列的移植工作交给了上村雅之的任天堂第二开发部 。
坂本贺勇的任天堂第一开发部则满足了GBA玩家对新作的渴望，《瓦力欧大陆4》作为GBA初期的最强动作游戏，充分发挥了这台掌机的性能，小游戏合集《瓦力欧制造》是休闲佳品 。《银河战士：融合》作为系列时隔8年推出的续作，让老玩家热泪盈眶，之后的《银河战士：零点任务》虽是复刻游戏，但内容堪比完全新作，诚意十足 。
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